RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547169.5

CTDSP2-202, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 1,340 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-202ENST00000547169 ATF3P18847 181 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-202ENST00000547169 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-202ENST00000547169 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-202ENST00000547169 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-202ENST00000547169 SLAIN2Q9P270 581 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-202ENST00000547169 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-202ENST00000547169 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-202ENST00000547169 DCCP43146 1447 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-202ENST00000547169 PIP4K2BP78356 416 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-202ENST00000547169 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-202ENST00000547169 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-202ENST00000547169 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDSP2-202ENST00000547169 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-202ENST00000547169 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-202ENST00000547169 MST1RQ04912 1400 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-202ENST00000547169 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-202ENST00000547169 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CTDSP2-202ENST00000547169 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 BRINP3Q76B58 766 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 ADGRB2O60241 1585 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 NUTM2FA1L443 756 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 ORAI2Q96SN7 254 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 CDK19Q9BWU1 502 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2-202ENST00000547169 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.08■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 HSPA1LP34931 641 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 EVC2Q86UK5 1308 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 SLC24A1O60721 1099 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 USP47Q96K76 1375 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDSP2-202ENST00000547169 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 TESK2Q96S53 571 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.01■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 CABP2Q9NPB3 220 aa22■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 USP32Q8NFA0 1604 aa21.99■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 FOXO3O43524 673 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.115e-13■■□□□ 11.6
CTDSP2-202ENST00000547169 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.95■■□□□ 1.11
CTDSP2-202ENST00000547169 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 PHLPP1O60346 1717 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 ATP7BP35670 1465 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 ITSN1Q15811 1721 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 KIF1AQ12756 1690 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 TMF1P82094 1093 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 PSME1Q06323 249 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 CABP1Q9NZU7 370 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.89■■□□□ 1.1
CTDSP2-202ENST00000547169 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 ACEP12821 1306 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 JCADQ9P266 1359 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 PXDNQ92626 1479 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 CDCA8Q53HL2 280 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 SBNO1A3KN83 1393 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-202ENST00000547169 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-202ENST00000547169 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-202ENST00000547169 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDSP2-202ENST00000547169 TMC1Q8TDI8 760 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDSP2-202ENST00000547169 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-202ENST00000547169 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDSP2-202ENST00000547169 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-202ENST00000547169 SHPRHQ149N8 1683 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDSP2-202ENST00000547169 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-202ENST00000547169 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.74■■□□□ 1.07
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