RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538734.6

MIR9-3HG-202, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 2

Gene MIR9-3HG, Length 1,877 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CPS1P31327 1500 aa27.98■■■□□ 2.07
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 CABP2Q9NPB3 220 aa27.95■■■□□ 2.06
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.94■■■□□ 2.06
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.94■■■□□ 2.06
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 CDK19Q9BWU1 502 aa27.91■■■□□ 2.06
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PIK3R4Q99570 1358 aa27.91■■■□□ 2.06
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TMC1Q8TDI8 760 aa27.9■■■□□ 2.06
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.9■■■□□ 2.06
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.89■■■□□ 2.06
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.86■■■□□ 2.05
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.83■■■□□ 2.05
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.78■■■□□ 2.04
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.73■■■□□ 2.03
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.71■■■□□ 2.03
MIR9-3HG-202ENST00000538734 A0A1W2PP64 1363 aa27.71■■■□□ 2.03
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.69■■■□□ 2.02
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NLRP13Q86W25 1043 aa27.68■■■□□ 2.02
MIR9-3HG-202ENST00000538734 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
MIR9-3HG-202ENST00000538734 USP32Q8NFA0 1604 aa27.67■■■□□ 2.02
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.67■■■□□ 2.02
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.66■■■□□ 2.02
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ATP7BP35670 1465 aa27.66■■■□□ 2.02
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.65■■■□□ 2.02
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NWD1Q149M9 1564 aa27.63■■■□□ 2.01
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 STRCQ7RTU9 1775 aa27.59■■■□□ 2.01
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.57■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.57■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.57■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MORC1Q86VD1 984 aa27.57■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.56■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FYB1O15117 783 aa27.54■■■□□ 2
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.53■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.53■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.53■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AKAP12Q02952 1782 aa27.52■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.51■■■□□ 2
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ITSN1Q15811 1721 aa27.51■■□□□ 1.99
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.5■■□□□ 1.99
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.5■■□□□ 1.99
MIR9-3HG-202ENST00000538734 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.49■■□□□ 1.99
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.46■■□□□ 1.99
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MIR9-3HG-202ENST00000538734 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.42■■□□□ 1.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 USP6P35125 1406 aa27.42■■□□□ 1.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TMEM94Q12767 1356 aa27.4■■□□□ 1.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NME9Q86XW9 330 aa27.4■■□□□ 1.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.4■■□□□ 1.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.39■■□□□ 1.98
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.38■■□□□ 1.97
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MTHFSP49914 203 aa27.38■■□□□ 1.97
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SSH2Q76I76 1423 aa27.37■■□□□ 1.97
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