RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	9.7	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		9.7	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	PRR29	P0C7W0	189 aa		9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	ANKRD7	Q92527	254 aa		9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	SSFA2	P28290	1259 aa		9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	TERF2	Q15554	542 aa		9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	EFCC1	Q9HA90	598 aa		9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	9.69	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		9.68	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		9.68	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		9.68	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	9.68	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	MPND	Q8N594	471 aa		9.68	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		9.67	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	9.67	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	9.67	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	RNF214	Q8ND24	703 aa		9.67	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		9.67	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	9.67	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	MCTP1	Q6DN14	999 aa		9.67	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		9.67	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		9.66	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	BCAR3	O75815	825 aa		9.66	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		9.66	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		9.66	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		9.66	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	9.66	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		9.66	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	HECW1	Q76N89	1606 aa		9.66	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	GOLGA2	Q08379	1002 aa		9.65	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	9.65	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		9.65	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		9.65	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	9.65	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	SNX21	Q969T3	373 aa		9.65	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	COG6	Q9Y2V7	657 aa		9.65	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	9.65	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	ZMYM3	Q14202	1370 aa		9.65	□□□□□ -0.86
ZNF438-208	ENST00000538351	TMX1	Q9H3N1	280 aa		9.65	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	9.65	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		9.65	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	9.65	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		9.65	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		9.64	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		9.64	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		9.64	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	SYCE3	A1L190	88 aa		9.64	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	BANK1	Q8NDB2	785 aa		9.64	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		9.64	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		9.64	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		9.64	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	CUL7	Q14999	1698 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	PANK1	Q8TE04	598 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	SIRT1	Q96EB6	747 aa		9.63	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	KRT222	Q8N1A0	295 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	INSR	P06213	1382 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		9.62	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		9.61	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		9.61	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	ERCC6	Q03468	1493 aa		9.61	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	PDE3A	Q14432	1141 aa		9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	SLFN5	Q08AF3	891 aa		9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	KIF18A	Q8NI77	898 aa		9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		9.6	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		9.59	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		9.59	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	GPT2	Q8TD30	523 aa		9.59	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		9.59	□□□□□ -0.87
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		9.59	□□□□□ -0.87

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