RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYT1Q01538 1121 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRWD3Q6RI45 1802 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXO3O43524 673 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAMC1P11047 1609 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUTM2FA1L443 756 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM182BQ5T319 152 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E9PCH4 1651 aa15.91■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLIT2O94813 1529 aa15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS72Q15906 364 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFFO2Q5TF58 517 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PXDNQ92626 1479 aa15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRL2O95490 1459 aa15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APLP2Q06481 763 aa15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP155O75694 1391 aa15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.81■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.8■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP32Q8NFA0 1604 aa15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.79■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM83GA6ND36 823 aa15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM37O94972 964 aa15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HFM1A2PYH4 1435 aa15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UTRNP46939 3433 aa15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APBA3O96018 575 aa15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTG4Q9NY30 223 aa15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STK26Q9P289 416 aa15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.74■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPON1Q9HCB6 807 aa15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAIPQ13075 1403 aa15.73■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.72■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DISP2A7MBM2 1401 aa15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1QTNF8P60827 252 aa15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NBPF14Q5TI25 921 aa15.71■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEP350Q5VT06 3117 aa15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNQ2O43526 872 aa15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITGAEP38570 1179 aa15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSME1Q06323 249 aa15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.7■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.69■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLTCL1P53675 1640 aa15.68■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.67■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15.66■□□□□ 0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRB2O60241 1585 aa15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGEF10O15013 1369 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP35Q9P2H5 1018 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRAPQ86VF7 1730 aa15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF1AQ12756 1690 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF1BO60333 1816 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROCK1Q13464 1354 aa15.61■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STRN4Q9NRL3 753 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SBNO1A3KN83 1393 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCA3Q99758 1704 aa15.6■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDE3BQ13370 1112 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.59■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB7AO95365 584 aa15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms