RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522519.5

MSC-AS1-208, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 1,537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-208ENST00000522519 C14orf37Q86TY3 774 aa22.36■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.36■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.34■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.34■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.34■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRAM1Q96QH2 718 aa22.33■■□□□ 1.17
MSC-AS1-208ENST00000522519 TOM1O60784 492 aa22.32■■□□□ 1.16
MSC-AS1-208ENST00000522519 FBXO41Q8TF61 875 aa22.31■■□□□ 1.16
MSC-AS1-208ENST00000522519 POGKQ9P215 609 aa22.3■■□□□ 1.16
MSC-AS1-208ENST00000522519 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.29■■□□□ 1.16
MSC-AS1-208ENST00000522519 MST1RQ04912 1400 aa22.28■■□□□ 1.16
MSC-AS1-208ENST00000522519 ATF3P18847 181 aa22.27■■□□□ 1.16
MSC-AS1-208ENST00000522519 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
MSC-AS1-208ENST00000522519 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 ITSN1Q15811 1721 aa22.27■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.26■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 USP32Q8NFA0 1604 aa22.26■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.24■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 SLAIN2Q9P270 581 aa22.22■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.22■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 PIP4K2BP78356 416 aa22.21■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIF1AQ12756 1690 aa22.21■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.21■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
MSC-AS1-208ENST00000522519 PHLPP1O60346 1717 aa22.2■■□□□ 1.14
MSC-AS1-208ENST00000522519 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.2■■□□□ 1.14
MSC-AS1-208ENST00000522519 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
MSC-AS1-208ENST00000522519 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
MSC-AS1-208ENST00000522519 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.17■■□□□ 1.14
MSC-AS1-208ENST00000522519 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.17■■□□□ 1.14
MSC-AS1-208ENST00000522519 USP47Q96K76 1375 aa22.16■■□□□ 1.14
MSC-AS1-208ENST00000522519 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MSC-AS1-208ENST00000522519 ATP7BP35670 1465 aa22.15■■□□□ 1.14
MSC-AS1-208ENST00000522519 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MSC-AS1-208ENST00000522519 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MSC-AS1-208ENST00000522519 BRINP3Q76B58 766 aa22.13■■□□□ 1.13
MSC-AS1-208ENST00000522519 NUTM2FA1L443 756 aa22.12■■□□□ 1.13
MSC-AS1-208ENST00000522519 ORAI2Q96SN7 254 aa22.1■■□□□ 1.13
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.09■■□□□ 1.13
MSC-AS1-208ENST00000522519 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.08■■□□□ 1.13
MSC-AS1-208ENST00000522519 CDK19Q9BWU1 502 aa22.08■■□□□ 1.13
MSC-AS1-208ENST00000522519 EVC2Q86UK5 1308 aa22.07■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 AKAP12Q02952 1782 aa22.06■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.06■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 HSPA1LP34931 641 aa22.06■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 TESK2Q96S53 571 aa22.06■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 SHPRHQ149N8 1683 aa22.05■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 CABP2Q9NPB3 220 aa22.02■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 PXDNQ92626 1479 aa22.02■■□□□ 1.12
MSC-AS1-208ENST00000522519 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.01■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 MYOM1P52179 1685 aa21.99■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.99■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.99■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.99■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.99■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 SLC24A1O60721 1099 aa21.98■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.98■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.98■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 ALS2Q96Q42 1657 aa21.98■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 FOXO3O43524 673 aa21.97■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.97■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
MSC-AS1-208ENST00000522519 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.94■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 TMF1P82094 1093 aa21.94■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 ABCA3Q99758 1704 aa21.93■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.93■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 JCADQ9P266 1359 aa21.91■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.91■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 ACEP12821 1306 aa21.9■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 CABP1Q9NZU7 370 aa21.9■■□□□ 1.1
MSC-AS1-208ENST00000522519 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.89■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.89■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.88■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 PSME1Q06323 249 aa21.88■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 SBNO1A3KN83 1393 aa21.88■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.88■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.87■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 CDCA8Q53HL2 280 aa21.86■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 USP6P35125 1406 aa21.86■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 PIK3C2AO00443 1686 aa21.85■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.85■■□□□ 1.09
MSC-AS1-208ENST00000522519 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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