RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518059.5

UBXN8-204, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-204ENST00000518059 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.93□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 EVC2Q86UK5 1308 aa9.92□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.92□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 PPP2R1AP30153 589 aa9.92□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.92□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.92□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 USP32Q8NFA0 1604 aa9.91□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.9□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 CAPN15O75808 1086 aa9.9□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.9□□□□□ -0.82
UBXN8-204ENST00000518059 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.89□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 NSD2O96028 1365 aa9.88□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.87□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.87□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 ALKQ9UM73 1620 aa9.87□□□□□ -0.83
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UBXN8-204ENST00000518059 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.87□□□□□ -0.83
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UBXN8-204ENST00000518059 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 MLECQ14165 292 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.86□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 MORC1Q86VD1 984 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 NGEFQ8N5V2 710 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 POGKQ9P215 609 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 DLC1Q96QB1 1528 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 PTPRMP28827 1452 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 CFAP53Q96M91 514 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 STK26Q9P289 416 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBXN8-204ENST00000518059 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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UBXN8-204ENST00000518059 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 TNRQ92752 1358 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.82□□□□□ -0.84
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UBXN8-204ENST00000518059 PRAM1Q96QH2 718 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 ZMYM3Q14202 1370 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
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UBXN8-204ENST00000518059 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 ABCC11Q96J66 1382 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 GOLGA2Q08379 1002 aa9.79□□□□□ -0.84
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UBXN8-204ENST00000518059 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 NLRP1Q9C000 1473 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
UBXN8-204ENST00000518059 MED14O60244 1454 aa9.78□□□□□ -0.84
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UBXN8-204ENST00000518059 ATP7BP35670 1465 aa9.77□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF521Q96K83 1311 aa9.77□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 SHPRHQ149N8 1683 aa9.77□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.76□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 E9PSI1 815 aa9.76□□□□□ -0.85
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UBXN8-204ENST00000518059 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.76□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 CDK19Q9BWU1 502 aa9.76□□□□□ -0.85
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UBXN8-204ENST00000518059 CPS1P31327 1500 aa9.76□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 TECPR2O15040 1411 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 APAF1O14727 1248 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 RUNDC1Q96C34 613 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 SIRT1Q96EB6 747 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 MTHFSP49914 203 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 SLFN5Q08AF3 891 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 POLA2Q14181 598 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.73□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.73□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.73□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.72□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.72□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 EID1Q9Y6B2 187 aa9.72□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 C3P01024 1663 aa9.71□□□□□ -0.85
UBXN8-204ENST00000518059 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
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