RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516978.2

SNORD19.2-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 19, humanhuman

BASIC

Gene SNORD19, Length 73 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD19.2-201ENST00000516978 TMEM88BA6NKF7 163 aa4.7□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa4.7□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 IGSF3O75054 1194 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 BRD1O95696 1058 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 PTPREP23469 700 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 KCNA1Q09470 495 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 MTMR2Q13614 643 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 NR6A1Q15406 480 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 DOK7Q18PE1 504 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 WASHC4Q2M389 1173 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 USTQ9Y2C2 406 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa4.68□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 POTEB2H3BUK9 544 aa4.68□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 FUT2Q10981 343 aa4.68□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 PACS2Q86VP3 889 aa4.68□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 KCNK17Q96T54 332 aa4.68□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 C6orf229H3BNL8 230 aa4.67□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 PIK3CDO00329 1044 aa4.67□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP46P62068 366 aa4.67□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 KIAA1468Q9P260 1216 aa4.67□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 PSEN2P49810 448 aa4.66□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.66□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa4.66□□□□□ -1.66
SNORD19.2-201ENST00000516978 ATG7O95352 703 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 STK32AQ8WU08 396 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 ZBED2Q9BTP6 218 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 RIMBP2O15034 1052 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 CFHP08603 1231 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 PDE4CQ08493 712 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 TMEM164Q5U3C3 297 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 POTEEQ6S8J3 1075 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 SLAIN2Q9P270 581 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 ATP9BO43861 1147 aa4.63□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 SEMA3FQ13275 785 aa4.63□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 CCDC27Q2M243 656 aa4.63□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 SLF2Q8IX21 1173 aa4.63□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 UNCXA6NJT0 531 aa4.62□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 FBXO45P0C2W1 286 aa4.62□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.62□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa4.62□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.62□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.62□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 FAM174AQ8TBP5 190 aa4.62□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 RNF40O75150 1001 aa4.61□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 SCNN1AP37088 669 aa4.61□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.61□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 AXIN2Q9Y2T1 843 aa4.61□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 E9PSI1 815 aa4.6□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 SOX11P35716 441 aa4.6□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.6□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.6□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L3A6NCW0 530 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L4A6NCW7 530 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 ATP6V1AP38606 617 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 NR1H3Q13133 447 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 MORN1Q5T089 497 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 RSPH4AQ5TD94 716 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L2Q6R6M4 530 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L1Q7RTZ2 530 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 RETREG3Q86VR2 466 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 MAP10Q9P2G4 905 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 RABGEF1Q9UJ41 708 aa4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L5A8MUK1 530 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 SKIP12755 728 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 LYPD8Q6UX82 237 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 TXNDC2Q86VQ3 553 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 ZBBXA8MT70 800 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L15C9J2P7 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L10C9JJH3 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L13C9JLJ4 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L12C9JPN9 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L11C9JVI0 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L21D6R901 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L18D6R9N7 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L22D6RA61 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L19D6RCP7 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 USP17L20D6RJB6 530 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD19.2-201ENST00000516978 F12P00748 615 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms