RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 AAASQ9NRG9 546 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC24Q8N4L8 307 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP46P62068 366 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 HLA-CQ95604 372 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC102AQ96A19 550 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 AXIN1O15169 862 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM32Q13049 653 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLCN1P35523 988 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 MMP16P51512 607 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-277P-201ENST00000516272 GUCA2AQ02747 115 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 WNT7AO00755 349 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXA2O43364 376 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 DACH1Q9UI36 760 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 AVPP01185 164 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.93□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMPD1P17405 629 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 C6orf229H3BNL8 230 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 J3QL48 77 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 JUNDP17535 347 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 FDX1P10109 184 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 WNT7BP56706 349 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 TREML4Q6UXN2 200 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 RETREG3Q86VR2 466 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALDH1A1P00352 501 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 SKOR1P84550 965 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 HPS1Q92902 700 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 MS4A1P11836 297 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-277P-201ENST00000516272 WFS1O76024 890 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFV2P19404 249 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 SENP2Q9HC62 589 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 BARGINQ6ZT62 677 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC01559Q495D7 138 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR7Q8TB68 274 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZMYND10O75800 440 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTMR2Q13614 643 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMHR2Q16671 573 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTPRNQ16849 979 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIFC2Q96AC6 838 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM47Q96LD4 638 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 SH3BP2P78314 561 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-277P-201ENST00000516272 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 BAP1Q92560 729 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIAH2O43255 324 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 BMP1P13497 986 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTHP32929 405 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNH2Q12809 1159 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.75□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 DESI1Q6ICB0 168 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF511Q8NB15 262 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM66O15016 1216 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-277P-201ENST00000516272 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU6-277P-201ENST00000516272 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms