RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 PHOX2BQ99453 314 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 AXIN1O15169 862 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 IRF6O14896 467 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIM32Q13049 653 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 ST8SIA5O15466 376 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 NLRP7Q8WX94 980 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLCN1P35523 988 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 WNT7BP56706 349 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 TREML4Q6UXN2 200 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 HOXA2O43364 376 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 SENP2Q9HC62 589 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-397P-201ENST00000516226 POTECB2RU33 542 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIFC2Q96AC6 838 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 JUNDP17535 347 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC102AQ96A19 550 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 SMPD1P17405 629 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 RETREG3Q86VR2 466 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 WFS1O76024 890 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIM47Q96LD4 638 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 WIPF1O43516 503 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 DACH1Q9UI36 760 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 J3QL48 77 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 FDX1P10109 184 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 MS4A1P11836 297 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 GJA5P36382 358 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTPRNQ16849 979 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 DESI1Q6ICB0 168 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 STK17AQ9UEE5 414 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 SKOR1P84550 965 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 HLA-CQ95604 372 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 C6orf229H3BNL8 230 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 AMHR2Q16671 573 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 MPNDQ8N594 471 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 HPS1Q92902 700 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 ALDH1A1P00352 501 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 GUCA2AQ02747 115 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-397P-201ENST00000516226 SIAH2O43255 324 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 BARGINQ6ZT62 677 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 MTMR2Q13614 643 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNH2Q12809 1159 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 SH3BP2P78314 561 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZMYND10O75800 440 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF511Q8NB15 262 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRR7Q8TB68 274 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-397P-201ENST00000516226 IRF7Q92985 503 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-397P-201ENST00000516226 ADH1CP00326 375 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCARF1Q14162 830 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms