RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRN4Q8WUT4 740 aa13.81□□□□□ -0.2
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PGGT1B-205ENST00000514178 WASHC4Q2M389 1173 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-205ENST00000514178 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-205ENST00000514178 SLF2Q8IX21 1173 aa13.8□□□□□ -0.2
PGGT1B-205ENST00000514178 CFHP08603 1231 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1B-205ENST00000514178 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1B-205ENST00000514178 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
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PGGT1B-205ENST00000514178 KCTD17Q8N5Z5 321 aa13.78□□□□□ -0.2
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PGGT1B-205ENST00000514178 ERBB3P21860 1342 aa13.76□□□□□ -0.21
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PGGT1B-205ENST00000514178 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP6V1AP38606 617 aa13.74□□□□□ -0.21
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PGGT1B-205ENST00000514178 EPS8L1Q8TE68 723 aa13.74□□□□□ -0.21
PGGT1B-205ENST00000514178 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
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PGGT1B-205ENST00000514178 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.71□□□□□ -0.21
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PGGT1B-205ENST00000514178 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.7□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 OTUD5Q96G74 571 aa13.7□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 NBPF3Q9H094 633 aa13.69□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 RFX1P22670 979 aa13.68□□□□□ -0.22
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PGGT1B-205ENST00000514178 ALG2Q9H553 416 aa13.68□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 NR6A1Q15406 480 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa13.67□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 MORN1Q5T089 497 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 RETREG3Q86VR2 466 aa13.66□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE4CQ08493 712 aa13.64□□□□□ -0.23
PGGT1B-205ENST00000514178 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
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PGGT1B-205ENST00000514178 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.63□□□□□ -0.23
PGGT1B-205ENST00000514178 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PGGT1B-205ENST00000514178 SOX11P35716 441 aa13.62□□□□□ -0.23
PGGT1B-205ENST00000514178 EMP3P54852 163 aa13.62□□□□□ -0.23
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.62□□□□□ -0.23
PGGT1B-205ENST00000514178 UCN2Q96RP3 112 aa13.62□□□□□ -0.23
PGGT1B-205ENST00000514178 Q3C1V9 767 aa13.61□□□□□ -0.23
PGGT1B-205ENST00000514178 DESI1Q6ICB0 168 aa13.61□□□□□ -0.23
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PGGT1B-205ENST00000514178 ST18O60284 1047 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 MARVELD3Q96A59 401 aa13.58□□□□□ -0.24
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PGGT1B-205ENST00000514178 USTQ9Y2C2 406 aa13.58□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.57□□□□□ -0.24
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PGGT1B-205ENST00000514178 SEMA3FQ13275 785 aa13.57□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 LYPD8Q6UX82 237 aa13.57□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 PNMA1Q8ND90 353 aa13.56□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM205CA6NFA0 338 aa13.55□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa13.55□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa13.54□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR14Q9BWN1 585 aa13.54□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.24
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PGGT1B-205ENST00000514178 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 NR1H3Q13133 447 aa13.51□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 TMCO4Q5TGY1 634 aa13.5□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 BRICD5Q6PL45 260 aa13.5□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.5□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa13.5□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 BRD1O95696 1058 aa13.49□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO45P0C2W1 286 aa13.49□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 CARNS1A5YM72 827 aa13.48□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 CDCA8Q53HL2 280 aa13.48□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP9BO43861 1147 aa13.47□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 ATG7O95352 703 aa13.47□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNA1Q09470 495 aa13.47□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKK1Q8NFD2 765 aa13.47□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 FKBPLQ9UIM3 349 aa13.47□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBBXA8MT70 800 aa13.46□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 HRO43593 1189 aa13.46□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 APLP1P51693 650 aa13.46□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.46□□□□□ -0.25
PGGT1B-205ENST00000514178 POTEB3A0JP26 581 aa13.45□□□□□ -0.26
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP4CP60510 307 aa13.45□□□□□ -0.26
PGGT1B-205ENST00000514178 POTEBQ6S5H4 581 aa13.45□□□□□ -0.26
PGGT1B-205ENST00000514178 THAP11Q96EK4 314 aa13.45□□□□□ -0.26
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