RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.72□□□□□ -0.53
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HERC3-210ENST00000512194 FAM205CA6NFA0 338 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-210ENST00000512194 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-210ENST00000512194 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.71□□□□□ -0.53
HERC3-210ENST00000512194 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.71□□□□□ -0.53
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HERC3-210ENST00000512194 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.69□□□□□ -0.54
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HERC3-210ENST00000512194 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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HERC3-210ENST00000512194 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.64□□□□□ -0.55
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HERC3-210ENST00000512194 ABCC2Q92887 1545 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-210ENST00000512194 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.62□□□□□ -0.55
HERC3-210ENST00000512194 KDM4AO75164 1064 aa11.62□□□□□ -0.55
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HERC3-210ENST00000512194 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-210ENST00000512194 POTEBQ6S5H4 581 aa11.6□□□□□ -0.55
HERC3-210ENST00000512194 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.59□□□□□ -0.55
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HERC3-210ENST00000512194 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
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HERC3-210ENST00000512194 TMEM259Q4ZIN3 620 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 NECTIN2Q92692 538 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 PTPRGP23470 1445 aa11.55□□□□□ -0.56
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HERC3-210ENST00000512194 NDUFV2P19404 249 aa11.55□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 KIF21BO75037 1637 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.54□□□□□ -0.56
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HERC3-210ENST00000512194 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-210ENST00000512194 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
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HERC3-210ENST00000512194 A6NJR5 290 aa11.51□□□□□ -0.57
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HERC3-210ENST00000512194 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
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HERC3-210ENST00000512194 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 PRXQ9BXM0 1461 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 CFHP08603 1231 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 QPCTQ16769 361 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 STAC3Q96MF2 364 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-210ENST00000512194 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
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