RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 PRR7Q8TB68 274 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 LHX6Q9UPM6 363 aa8.28□□□□□ -1.08
HERC3-209ENST00000504994 CFAP99D6REC4 459 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 GPR153Q6NV75 609 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 TSC1Q92574 1164 aa8.27□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 MTMR2Q13614 643 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 CDCA8Q53HL2 280 aa8.26□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 IGSF3O75054 1194 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 ATG7O95352 703 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 POTEIP0CG38 1075 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 PTPREP23469 700 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 DOK7Q18PE1 504 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 CCDC27Q2M243 656 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 PACS2Q86VP3 889 aa8.25□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 SLC10A3P09131 477 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 PROX2Q3B8N5 592 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 E9PSI1 815 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-209ENST00000504994 SOX11P35716 441 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 RIMBP2O15034 1052 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 NR6A1Q15406 480 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 C6orf229H3BNL8 230 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 SEMA3FQ13275 785 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 ATP9BO43861 1147 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 SLF2Q8IX21 1173 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 FUT2Q10981 343 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.17□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 KCNK17Q96T54 332 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 PIK3CDO00329 1044 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 STK32AQ8WU08 396 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-209ENST00000504994 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 UNCXA6NJT0 531 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 CFHP08603 1231 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 POTEJP0CG39 1038 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 FBXO45P0C2W1 286 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 NR1H3Q13133 447 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 PNMA1Q8ND90 353 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 USP17L3A6NCW0 530 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 USP17L4A6NCW7 530 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 RETREG3Q86VR2 466 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 ATP6V1AP38606 617 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 SLAIN2Q9P270 581 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-209ENST00000504994 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L5A8MUK1 530 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 PSEN2P49810 448 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 ZBBXA8MT70 800 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L15C9J2P7 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L10C9JJH3 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L12C9JPN9 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L11C9JVI0 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L21D6R901 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L18D6R9N7 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L22D6RA61 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L19D6RCP7 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L20D6RJB6 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 SKIP12755 728 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 USP17L24Q0WX57 530 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 DESI1Q6ICB0 168 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 LYPD8Q6UX82 237 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-209ENST00000504994 KCNH8Q96L42 1107 aa8.06□□□□□ -1.12
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