RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ECHDC3-204ENST00000495787 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 LRP6O75581 1613 aa14.88□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC24A1O60721 1099 aa14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TMF1P82094 1093 aa14.87□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 C14orf37Q86TY3 774 aa14.86□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ANP32CO43423 234 aa14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 TBX22Q9Y458 520 aa14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3-204ENST00000495787 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SHPRHQ149N8 1683 aa14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.82□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 ATF3P18847 181 aa14.82□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 RXRBP28702 533 aa14.82□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CDCA8Q53HL2 280 aa14.82□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.82□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 PIK3R4Q99570 1358 aa14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 DIP2AQ14689 1571 aa14.79□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.78□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 DLC1Q96QB1 1528 aa14.77□□□□□ -0.04
ECHDC3-204ENST00000495787 CCER2I3L3R5 266 aa14.77□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 BRINP3Q76B58 766 aa14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 AFF2P51816 1311 aa14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 DCCP43146 1447 aa14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 STK26Q9P289 416 aa14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 MYOM1P52179 1685 aa14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 ABCC11Q96J66 1382 aa14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 METP08581 1390 aa14.72□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 SIRT1Q96EB6 747 aa14.71□□□□□ -0.05
ECHDC3-204ENST00000495787 EVC2Q86UK5 1308 aa14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 RGS12O14924 1447 aa14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 TECPR2O15040 1411 aa14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 PTPRUQ92729 1446 aa14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 PRAM1Q96QH2 718 aa14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 PANK3Q9H999 370 aa14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 POGKQ9P215 609 aa14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.7□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 MST1RQ04912 1400 aa14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 C8orf37Q96NL8 207 aa14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.69□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 RALBP1Q15311 655 aa14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 NGLY1Q96IV0 654 aa14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ECHDC3-204ENST00000495787 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.64□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.63□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 ADAMTS2O95450 1211 aa14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 CABP2Q9NPB3 220 aa14.61□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 PTCH1Q13635 1447 aa14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 TMC1Q8TDI8 760 aa14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 CDK19Q9BWU1 502 aa14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 ADGRB2O60241 1585 aa14.6□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 USP21Q9UK80 565 aa14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ECHDC3-204ENST00000495787 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ECHDC3-204ENST00000495787 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91 ms