RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 MS4A1P11836 297 aa27.91■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CERKL-213ENST00000494398 PDE4AP27815 886 aa27.87■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 ZFYVE9O95405 1425 aa27.86■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 CABP2Q9NPB3 220 aa27.86■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 STK26Q9P289 416 aa27.86■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 MTHFSP49914 203 aa27.85■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 WWC1Q8IX03 1113 aa27.85■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.84■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.84■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 CFAP53Q96M91 514 aa27.84■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 RUNDC1Q96C34 613 aa27.83■■■□□ 2.05
CERKL-213ENST00000494398 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.82■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 BACH2Q9BYV9 841 aa27.82■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.81■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 BCAR3O75815 825 aa27.8■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 NEUROD2Q15784 382 aa27.8■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.8■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 USP32Q8NFA0 1604 aa27.79■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 NSD2O96028 1365 aa27.79■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 SKAP1Q86WV1 359 aa27.77■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.77■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CERKL-213ENST00000494398 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.75■■■□□ 2.03
CERKL-213ENST00000494398 POGKQ9P215 609 aa27.74■■■□□ 2.03
CERKL-213ENST00000494398 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.74■■■□□ 2.03
CERKL-213ENST00000494398 SHPRHQ149N8 1683 aa27.74■■■□□ 2.03
CERKL-213ENST00000494398 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.74■■■□□ 2.03
CERKL-213ENST00000494398 PRAM1Q96QH2 718 aa27.73■■■□□ 2.03
CERKL-213ENST00000494398 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.73■■■□□ 2.03
CERKL-213ENST00000494398 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CERKL-213ENST00000494398 A0A1W2PP64 1363 aa27.7■■■□□ 2.03
CERKL-213ENST00000494398 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.69■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 WDR63Q8IWG1 891 aa27.69■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.69■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.68■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.68■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 PTPRMP28827 1452 aa27.68■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 ABCC11Q96J66 1382 aa27.67■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 PDE3AQ14432 1141 aa27.67■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 CCDC27Q2M243 656 aa27.66■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.66■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.66■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.66■■■□□ 2.02
CERKL-213ENST00000494398 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 DIP2BQ9P265 1576 aa27.6■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 FYB1O15117 783 aa27.6■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 CDK19Q9BWU1 502 aa27.6■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 RARSP54136 660 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 ALKQ9UM73 1620 aa27.59■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 PANK1Q8TE04 598 aa27.58■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.58■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 COG6Q9Y2V7 657 aa27.58■■■□□ 2.01
CERKL-213ENST00000494398 NBR1Q14596 966 aa27.57■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.56■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.56■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.56■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 MLECQ14165 292 aa27.56■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 AGLP35573 1532 aa27.56■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 CABP1Q9NZU7 370 aa27.56■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 TSPOAP1O95153 1857 aa27.55■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 RGS3P49796 1198 aa27.55■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.55■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.54■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 REREQ9P2R6 1566 aa27.54■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 FAM161AQ3B820 660 aa27.53■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 IGHDP01880 384 aa27.52■■■□□ 2
CERKL-213ENST00000494398 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.51■■■□□ 2
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CERKL-213ENST00000494398 MED14O60244 1454 aa27.51■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.51■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.5■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.5■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.49■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.49■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.48■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 NLRP1Q9C000 1473 aa27.48■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 C8orf34Q49A92 452 aa27.48■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CERKL-213ENST00000494398 AAMPQ13685 434 aa27.46■■□□□ 1.99
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