RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
HOXD10-202ENST00000490088 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXD10-202ENST00000490088 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD10-202ENST00000490088 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
HOXD10-202ENST00000490088 USP47Q96K76 1375 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD10-202ENST00000490088 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
HOXD10-202ENST00000490088 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
HOXD10-202ENST00000490088 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD10-202ENST00000490088 DCCP43146 1447 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXD10-202ENST00000490088 ATF3P18847 181 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXD10-202ENST00000490088 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXD10-202ENST00000490088 ADGRB2O60241 1585 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXD10-202ENST00000490088 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXD10-202ENST00000490088 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.45■■■□□ 2.47
HOXD10-202ENST00000490088 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.44■■■□□ 2.46
HOXD10-202ENST00000490088 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.46
HOXD10-202ENST00000490088 TOM1O60784 492 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXD10-202ENST00000490088 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
HOXD10-202ENST00000490088 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
HOXD10-202ENST00000490088 NUTM2FA1L443 756 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXD10-202ENST00000490088 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.39■■■□□ 2.45
HOXD10-202ENST00000490088 MST1RQ04912 1400 aa30.39■■■□□ 2.45
HOXD10-202ENST00000490088 TESK2Q96S53 571 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD10-202ENST00000490088 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD10-202ENST00000490088 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXD10-202ENST00000490088 SLAIN2Q9P270 581 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXD10-202ENST00000490088 CDK19Q9BWU1 502 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXD10-202ENST00000490088 PIP4K2BP78356 416 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXD10-202ENST00000490088 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD10-202ENST00000490088 EVC2Q86UK5 1308 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD10-202ENST00000490088 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
HOXD10-202ENST00000490088 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
HOXD10-202ENST00000490088 CABP2Q9NPB3 220 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXD10-202ENST00000490088 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXD10-202ENST00000490088 USP32Q8NFA0 1604 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXD10-202ENST00000490088 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD10-202ENST00000490088 ORAI2Q96SN7 254 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD10-202ENST00000490088 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD10-202ENST00000490088 ATP7BP35670 1465 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXD10-202ENST00000490088 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
HOXD10-202ENST00000490088 SLC24A1O60721 1099 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD10-202ENST00000490088 TMF1P82094 1093 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD10-202ENST00000490088 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD10-202ENST00000490088 BRINP3Q76B58 766 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD10-202ENST00000490088 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD10-202ENST00000490088 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
HOXD10-202ENST00000490088 FBXO41Q8TF61 875 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD10-202ENST00000490088 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD10-202ENST00000490088 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD10-202ENST00000490088 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD10-202ENST00000490088 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD10-202ENST00000490088 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXD10-202ENST00000490088 ITSN1Q15811 1721 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXD10-202ENST00000490088 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.15■■■□□ 2.42
HOXD10-202ENST00000490088 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
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HOXD10-202ENST00000490088 KIF1AQ12756 1690 aa30.14■■■□□ 2.41
HOXD10-202ENST00000490088 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
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HOXD10-202ENST00000490088 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.09■■■□□ 2.41
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HOXD10-202ENST00000490088 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
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HOXD10-202ENST00000490088 ACEP12821 1306 aa30.06■■■□□ 2.4
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HOXD10-202ENST00000490088 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXD10-202ENST00000490088 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.05■■■□□ 2.4
HOXD10-202ENST00000490088 HSPA1LP34931 641 aa30.04■■■□□ 2.4
HOXD10-202ENST00000490088 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
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HOXD10-202ENST00000490088 PHLPP1O60346 1717 aa30.03■■■□□ 2.4
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HOXD10-202ENST00000490088 PSME1Q06323 249 aa30.01■■■□□ 2.39
HOXD10-202ENST00000490088 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.01■■■□□ 2.39
HOXD10-202ENST00000490088 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.01■■■□□ 2.39
HOXD10-202ENST00000490088 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
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HOXD10-202ENST00000490088 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
HOXD10-202ENST00000490088 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.99■■■□□ 2.39
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HOXD10-202ENST00000490088 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
HOXD10-202ENST00000490088 A0A1W2PP64 1363 aa29.94■■■□□ 2.38
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HOXD10-202ENST00000490088 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXD10-202ENST00000490088 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
HOXD10-202ENST00000490088 AKAP12Q02952 1782 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
HOXD10-202ENST00000490088 USP6P35125 1406 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXD10-202ENST00000490088 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXD10-202ENST00000490088 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
HOXD10-202ENST00000490088 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
HOXD10-202ENST00000490088 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
HOXD10-202ENST00000490088 SBNO1A3KN83 1393 aa29.9■■■□□ 2.38
HOXD10-202ENST00000490088 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.89■■■□□ 2.38
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