RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.89■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.89■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.88■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 RNF20Q5VTR2 975 aa20.88■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.88■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 ERC2O15083 957 aa20.87■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.87■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.87■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 MARCH6O60337 910 aa20.87■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.87■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 RAPGEF3O95398 923 aa20.86■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 CDK19Q9BWU1 502 aa20.86■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.85■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.85■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 VPS37DQ86XT2 251 aa20.85■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.85■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 ERBINQ96RT1 1412 aa20.84■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
NISCH-213ENST00000489895 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.83■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 GNAI3P08754 354 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 PRKAR2BP31323 418 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 TRDNQ13061 729 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 WWC1Q8IX03 1113 aa20.81■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.8■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 CABP1Q9NZU7 370 aa20.8■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 GRIN2AQ12879 1464 aa20.8■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 APPP05067 770 aa20.79■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 TRIM29Q14134 588 aa20.79■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.78■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 CD109Q6YHK3 1445 aa20.78■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
NISCH-213ENST00000489895 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 NAIPQ13075 1403 aa20.76■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 CPLX1O14810 134 aa20.76■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 VPS53Q5VIR6 699 aa20.76■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 ARHGEF11O15085 1522 aa20.76■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 MAP3K1Q13233 1512 aa20.76■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.75■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 PANK1Q8TE04 598 aa20.75■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 LNPKQ9C0E8 428 aa20.74■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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NISCH-213ENST00000489895 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.73■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 ERICH2A1L162 156 aa20.73■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 PDE3AQ14432 1141 aa20.73■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 WDR63Q8IWG1 891 aa20.73■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 MCTP1Q6DN14 999 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.72■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 CDC45O75419 566 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.71■□□□□ 0.91
NISCH-213ENST00000489895 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 SPG7Q9UQ90 795 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.7■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 ADGRL1O94910 1474 aa20.69■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 CNTROBQ8N137 903 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 TPM3P06753 285 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 BECN2A8MW95 431 aa20.68■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 NUCB2P80303 420 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 TPM2P07951 284 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 GCC1Q96CN9 775 aa20.67■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 ABCC5O15440 1437 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.66■□□□□ 0.9
NISCH-213ENST00000489895 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.66■□□□□ 0.9
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