RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 LILRB3O75022 631 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 COPS2P61201 443 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 KCNC4Q03721 635 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 QPCTQ16769 361 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 BANK1Q8NDB2 785 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 ZMYND15Q9H091 742 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 MCM6Q14566 821 aa9.94□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 ZPR1O75312 459 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 GUCA2AQ02747 115 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 Q3C1V9 767 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 HRCP23327 699 aa9.92□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.92□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 HLA-CQ95604 372 aa9.92□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 IFFO2Q5TF58 517 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 ZNF516Q92618 1163 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 MTMR2Q13614 643 aa9.9□□□□□ -0.82
CCL20-204ENST00000489160 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.89□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 C6orf229H3BNL8 230 aa9.88□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 BRICD5Q6PL45 260 aa9.88□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 THAP11Q96EK4 314 aa9.88□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 AP1G2O75843 785 aa9.87□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 SPSB2Q99619 263 aa9.87□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 ADH1BP00325 375 aa9.86□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 SNRKQ9NRH2 765 aa9.86□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 A6NJR5 290 aa9.85□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 SOCS7O14512 581 aa9.85□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 APBB1O00213 710 aa9.84□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 TLL1O43897 1013 aa9.84□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.84□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 RETREG3Q86VR2 466 aa9.84□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CCL20-204ENST00000489160 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 RAD21O60216 631 aa9.83□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 USP17L8P0C7I0 530 aa9.83□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.83□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.83□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 CFAP99D6REC4 459 aa9.82□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 MSS51Q4VC12 460 aa9.82□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.82□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 GGCXP38435 758 aa9.81□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 PRR7Q8TB68 274 aa9.81□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.81□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 TSC1Q92574 1164 aa9.8□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.79□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 POM121Q96HA1 1249 aa9.79□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.79□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 COG6Q9Y2V7 657 aa9.79□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 DESI1Q6ICB0 168 aa9.78□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCL20-204ENST00000489160 A0A0G2JS52 829 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 TRAK2O60296 914 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 S1PR4O95977 384 aa9.76□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 MMP16P51512 607 aa9.76□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.76□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 JUNDP17535 347 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 WWC1Q8IX03 1113 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 RNF223E7ERA6 249 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 LYPD8Q6UX82 237 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-204ENST00000489160 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 ABL2P42684 1182 aa9.7□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 PTPRNQ16849 979 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 ARID3CA6NKF2 412 aa9.67□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 RGS20O76081 388 aa9.67□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.67□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-204ENST00000489160 NR6A1Q15406 480 aa9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms