RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-210ENST00000485459 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-210ENST00000485459 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-210ENST00000485459 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC19A1P41440 591 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-210ENST00000485459 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-210ENST00000485459 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGGTB-210ENST00000485459 RETREG3Q86VR2 466 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MTMR2Q13614 643 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 NEUROD2Q15784 382 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 GJA5P36382 358 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 SPTLC1O15269 473 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 MMP16P51512 607 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-210ENST00000485459 JUNDP17535 347 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM117AQ9C073 453 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRYD7Q5W111 196 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR7Q8TB68 274 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 GFRA3O60609 400 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 HRCP23327 699 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 RPIAP49247 311 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 TSC1Q92574 1164 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.79□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 LAPTM4AQ15012 233 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-210ENST00000485459 QPCTQ16769 361 aa9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 CFAP99D6REC4 459 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXC1Q12948 553 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM32Q13049 653 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 PTPRNQ16849 979 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 Q6ZNB5 142 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 TNFRSF10AO00220 468 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 DESI1Q6ICB0 168 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 IL27Q8NEV9 243 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 LILRB3O75022 631 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-210ENST00000485459 CTHP32929 405 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR20EP86478 221 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR20CP86479 221 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR20DP86480 221 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR20BP86481 221 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR20AP86496 221 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 LYPD8Q6UX82 237 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 GDF9O60383 454 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNH2Q12809 1159 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 PKDCCQ504Y2 493 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP4X1Q8N118 509 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 WNT7AO00755 349 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 WNT7BP56706 349 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP10Q9P2G4 905 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-210ENST00000485459 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM187AA6NFU0 413 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC01559Q495D7 138 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-210ENST00000485459 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-210ENST00000485459 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms