RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483088.1

N4BP2L2-208, Transcript of NEDD4 binding protein 2 like 2, human

TSL 2

Gene N4BP2L2, Length 716 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		7.54	□□□□□ -1.2
N4BP2L2-208	ENST00000483088		A0A0G2JS52	829 aa		7.53	□□□□□ -1.2
N4BP2L2-208	ENST00000483088	NR1I2	O75469	434 aa		7.53	□□□□□ -1.2
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		7.53	□□□□□ -1.2
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SYNJ2	O15056	1496 aa		7.53	□□□□□ -1.2
N4BP2L2-208	ENST00000483088	KDM4A	O75164	1064 aa		7.52	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		7.52	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MORN1	Q5T089	497 aa		7.52	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		7.52	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	USP46	P62068	366 aa		7.51	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		7.5	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	KDM6B	O15054	1643 aa		7.49	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MS4A1	P11836	297 aa		7.49	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		7.49	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		7.49	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		7.49	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		7.49	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ADGRL1	O94910	1474 aa		7.48	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	HOXA2	O43364	376 aa		7.47	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TLL1	O43897	1013 aa		7.47	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RGS20	O76081	388 aa		7.47	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ADH1B	P00325	375 aa		7.47	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		7.47	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	THAP11	Q96EK4	314 aa		7.47	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		7.47	□□□□□ -1.21
N4BP2L2-208	ENST00000483088	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	BRICD5	Q6PL45	260 aa		7.46	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		7.46	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SPSB2	Q99619	263 aa		7.46	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		7.46	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GGCX	P38435	758 aa		7.45	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		7.45	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088		Q3C1V9	767 aa		7.45	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	HLA-C	Q95604	372 aa		7.45	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	IFT140	Q96RY7	1462 aa		7.44	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GUCA2A	Q02747	115 aa		7.43	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		7.43	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		7.43	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		7.42	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	S1PR4	O95977	384 aa		7.42	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		7.42	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		7.42	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		7.42	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		7.42	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RNF223	E7ERA6	249 aa		7.41	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	FDX1	P10109	184 aa		7.41	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	NDUFV2	P19404	249 aa		7.41	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		7.41	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SYNJ1	O43426	1573 aa		7.41	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GJA5	P36382	358 aa		7.4	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MSS51	Q4VC12	460 aa		7.4	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		7.39	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SPTLC1	O15269	473 aa		7.38	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		7.38	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	FAM117A	Q9C073	453 aa		7.38	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		7.38	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	NEUROD2	Q15784	382 aa		7.37	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		7.37	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		7.37	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	C6orf229	H3BNL8	230 aa		7.36	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MMP16	P51512	607 aa		7.36	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RETREG3	Q86VR2	466 aa		7.36	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		7.36	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		7.36	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		7.36	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TSPOAP1	O95153	1857 aa		7.36	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		7.35	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		7.34	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		7.34	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MTMR2	Q13614	643 aa		7.34	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		7.34	□□□□□ -1.23
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SLC19A1	P41440	591 aa		7.33	□□□□□ -1.24
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
N4BP2L2-208	ENST00000483088	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
N4BP2L2-208	ENST00000483088	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		7.33	□□□□□ -1.24
N4BP2L2-208	ENST00000483088	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
N4BP2L2-208	ENST00000483088	JUND	P17535	347 aa		7.32	□□□□□ -1.24
N4BP2L2-208	ENST00000483088	HRC	P23327	699 aa		7.32	□□□□□ -1.24
N4BP2L2-208	ENST00000483088	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		7.32	□□□□□ -1.24
N4BP2L2-208	ENST00000483088	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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