RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.89□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.89□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 OFD1O75665 1012 aa14.89□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.89□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 APBB1O00213 710 aa14.89□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.88□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 PDILTQ8N807 584 aa14.88□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 STAMBPO95630 424 aa14.88□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 SMC2O95347 1197 aa14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 ARID3CA6NKF2 412 aa14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 DAAM2Q86T65 1068 aa14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 FBLN2P98095 1184 aa14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 DACH1Q9UI36 760 aa14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 CCDC181Q5TID7 509 aa14.86□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 KIF18AQ8NI77 898 aa14.86□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 A0A0G2JS52 829 aa14.86□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.86□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.86□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 E9PSI1 815 aa14.86□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.86□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 CPLX1O14810 134 aa14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 KANK1Q14678 1352 aa14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 KRT222Q8N1A0 295 aa14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 KIF3CO14782 793 aa14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 KIF20AO95235 890 aa14.84□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 SCRIBQ14160 1630 aa14.84□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 NEMFO60524 1076 aa14.84□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.84□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SOGA3-207ENST00000481848 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.83□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 SDF4Q9BRK5 362 aa14.83□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 SLC4A3P48751 1232 aa14.83□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 A0A1B0GUA9 196 aa14.83□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 CCDC175P0C221 793 aa14.83□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.83□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 JMYQ8N9B5 988 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 HSPA4P34932 840 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 ZSCAN12O43309 604 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 POGKQ9P215 609 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 TUBB4BP68371 445 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 WWC1Q8IX03 1113 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.81□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 PSMA5P28066 241 aa14.81□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.81□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.81□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 CFAP45Q9UL16 551 aa14.81□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 CBX1P83916 185 aa14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 TCHPQ9BT92 498 aa14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 MYZAPP0CAP1 466 aa14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.79□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.79□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.79□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.79□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.78□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.78□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 STIM1Q13586 685 aa14.78□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.78□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 VPS53Q5VIR6 699 aa14.78□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 TNNT1P13805 278 aa14.77□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.77□□□□□ -0.04
SOGA3-207ENST00000481848 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms