RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478424.5

ARF1-209, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARF1, Length 1,059 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-209ENST00000478424 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.77■■■■□ 3.48
ARF1-209ENST00000478424 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
ARF1-209ENST00000478424 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.76■■■■□ 3.48
ARF1-209ENST00000478424 NUTM2FA1L443 756 aa36.75■■■■□ 3.47
ARF1-209ENST00000478424 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.74■■■■□ 3.47
ARF1-209ENST00000478424 TECPR2O15040 1411 aa36.72■■■■□ 3.47
ARF1-209ENST00000478424 ADAMTS2O95450 1211 aa36.72■■■■□ 3.47
ARF1-209ENST00000478424 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.71■■■■□ 3.47
ARF1-209ENST00000478424 RXRBP28702 533 aa36.7■■■■□ 3.47
ARF1-209ENST00000478424 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
ARF1-209ENST00000478424 LAMC1P11047 1609 aa36.69■■■■□ 3.46
ARF1-209ENST00000478424 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
ARF1-209ENST00000478424 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.68■■■■□ 3.46
ARF1-209ENST00000478424 ABCC11Q96J66 1382 aa36.68■■■■□ 3.46
ARF1-209ENST00000478424 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
ARF1-209ENST00000478424 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.64■■■■□ 3.46
ARF1-209ENST00000478424 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.63■■■■□ 3.45
ARF1-209ENST00000478424 NGLY1Q96IV0 654 aa36.63■■■■□ 3.45
ARF1-209ENST00000478424 MYOM2P54296 1465 aa36.62■■■■□ 3.45
ARF1-209ENST00000478424 FOXO3O43524 673 aa36.61■■■■□ 3.45
ARF1-209ENST00000478424 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
ARF1-209ENST00000478424 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.58■■■■□ 3.45
ARF1-209ENST00000478424 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
ARF1-209ENST00000478424 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.58■■■■□ 3.45
ARF1-209ENST00000478424 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
ARF1-209ENST00000478424 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.55■■■■□ 3.44
ARF1-209ENST00000478424 PXDNQ92626 1479 aa36.55■■■■□ 3.44
ARF1-209ENST00000478424 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.51■■■■□ 3.44
ARF1-209ENST00000478424 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
ARF1-209ENST00000478424 PRAM1Q96QH2 718 aa36.5■■■■□ 3.43
ARF1-209ENST00000478424 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
ARF1-209ENST00000478424 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
ARF1-209ENST00000478424 POGKQ9P215 609 aa36.48■■■■□ 3.43
ARF1-209ENST00000478424 USP21Q9UK80 565 aa36.48■■■■□ 3.43
ARF1-209ENST00000478424 RGS12O14924 1447 aa36.47■■■■□ 3.43
ARF1-209ENST00000478424 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.46■■■■□ 3.434e-16■■■■■ 73.2
ARF1-209ENST00000478424 SIRT1Q96EB6 747 aa36.46■■■■□ 3.43
ARF1-209ENST00000478424 KIF1AQ12756 1690 aa36.45■■■■□ 3.43
ARF1-209ENST00000478424 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.45■■■■□ 3.43
ARF1-209ENST00000478424 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.41■■■■□ 3.42
ARF1-209ENST00000478424 PLEKHG5O94827 1062 aa36.4■■■■□ 3.42
ARF1-209ENST00000478424 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
ARF1-209ENST00000478424 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.39■■■■□ 3.42
ARF1-209ENST00000478424 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
ARF1-209ENST00000478424 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.38■■■■□ 3.41
ARF1-209ENST00000478424 DLC1Q96QB1 1528 aa36.38■■■■□ 3.41
ARF1-209ENST00000478424 ADGRB1O14514 1584 aa36.36■■■■□ 3.41
ARF1-209ENST00000478424 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.35■■■■□ 3.41
ARF1-209ENST00000478424 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
ARF1-209ENST00000478424 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
ARF1-209ENST00000478424 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
ARF1-209ENST00000478424 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.33■■■■□ 3.41
ARF1-209ENST00000478424 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
ARF1-209ENST00000478424 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
ARF1-209ENST00000478424 HRCP23327 699 aa36.32■■■■□ 3.4
ARF1-209ENST00000478424 PSME1Q06323 249 aa36.3■■■■□ 3.4
ARF1-209ENST00000478424 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.3■■■■□ 3.4
ARF1-209ENST00000478424 ATRNO75882 1429 aa36.3■■■■□ 3.4
ARF1-209ENST00000478424 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.3■■■■□ 3.4
ARF1-209ENST00000478424 ADGRB2O60241 1585 aa36.27■■■■□ 3.4
ARF1-209ENST00000478424 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.25■■■■□ 3.39
ARF1-209ENST00000478424 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.24■■■■□ 3.39
ARF1-209ENST00000478424 USP32Q8NFA0 1604 aa36.23■■■■□ 3.39
ARF1-209ENST00000478424 CABLES1Q8TDN4 633 aa36.23■■■■□ 3.39
ARF1-209ENST00000478424 STAC3Q96MF2 364 aa36.21■■■■□ 3.39
ARF1-209ENST00000478424 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.2■■■■□ 3.39
ARF1-209ENST00000478424 SBNO1A3KN83 1393 aa36.19■■■■□ 3.38
ARF1-209ENST00000478424 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
ARF1-209ENST00000478424 ARHGEF10O15013 1369 aa36.17■■■■□ 3.38
ARF1-209ENST00000478424 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.16■■■■□ 3.38
ARF1-209ENST00000478424 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.15■■■■□ 3.38
ARF1-209ENST00000478424 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
ARF1-209ENST00000478424 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.15■■■■□ 3.38
ARF1-209ENST00000478424 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
ARF1-209ENST00000478424 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
ARF1-209ENST00000478424 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.14■■■■□ 3.38
ARF1-209ENST00000478424 SLIT2O94813 1529 aa36.13■■■■□ 3.37
ARF1-209ENST00000478424 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
ARF1-209ENST00000478424 ABCA3Q99758 1704 aa36.1■■■■□ 3.37
ARF1-209ENST00000478424 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
ARF1-209ENST00000478424 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.09■■■■□ 3.37
ARF1-209ENST00000478424 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
ARF1-209ENST00000478424 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.06■■■■□ 3.36
ARF1-209ENST00000478424 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
ARF1-209ENST00000478424 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
ARF1-209ENST00000478424 GLI3P10071 1580 aa36.04■■■■□ 3.36
ARF1-209ENST00000478424 ATP7BP35670 1465 aa35.99■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 ITSN1Q15811 1721 aa35.99■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 ALS2Q96Q42 1657 aa35.97■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.97■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 FAM83GA6ND36 823 aa35.97■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.97■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 CDK19Q9BWU1 502 aa35.97■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.97■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 VPS72Q15906 364 aa35.96■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 A0A0G2JS52 829 aa35.95■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 MYT1Q01538 1121 aa35.95■■■■□ 3.35
ARF1-209ENST00000478424 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.92■■■■□ 3.34
ARF1-209ENST00000478424 BTG4Q9NY30 223 aa35.9■■■■□ 3.34
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