RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ACTB-210ENST00000477812 POGKQ9P215 609 aa28.24■■■□□ 2.11
ACTB-210ENST00000477812 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
ACTB-210ENST00000477812 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.22■■■□□ 2.11
ACTB-210ENST00000477812 CERKQ8TCT0 537 aa28.22■■■□□ 2.11
ACTB-210ENST00000477812 DCCP43146 1447 aa28.21■■■□□ 2.11
ACTB-210ENST00000477812 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.21■■■□□ 2.11
ACTB-210ENST00000477812 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.19■■■□□ 2.1
ACTB-210ENST00000477812 MSH6P52701 1360 aa28.18■■■□□ 2.1
ACTB-210ENST00000477812 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.17■■■□□ 2.1
ACTB-210ENST00000477812 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ACTB-210ENST00000477812 C14orf37Q86TY3 774 aa28.16■■■□□ 2.1
ACTB-210ENST00000477812 TESK2Q96S53 571 aa28.16■■■□□ 2.1
ACTB-210ENST00000477812 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.15■■■□□ 2.1
ACTB-210ENST00000477812 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
ACTB-210ENST00000477812 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
ACTB-210ENST00000477812 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ACTB-210ENST00000477812 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.12■■■□□ 2.09
ACTB-210ENST00000477812 MST1RQ04912 1400 aa28.09■■■□□ 2.09
ACTB-210ENST00000477812 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
ACTB-210ENST00000477812 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.08■■■□□ 2.09
ACTB-210ENST00000477812 ATF3P18847 181 aa28.06■■■□□ 2.08
ACTB-210ENST00000477812 USP32Q8NFA0 1604 aa28.06■■■□□ 2.08
ACTB-210ENST00000477812 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.03■■■□□ 2.08
ACTB-210ENST00000477812 ATP7BP35670 1465 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTB-210ENST00000477812 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTB-210ENST00000477812 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTB-210ENST00000477812 EVC2Q86UK5 1308 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTB-210ENST00000477812 CDK19Q9BWU1 502 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTB-210ENST00000477812 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.01■■■□□ 2.07
ACTB-210ENST00000477812 SLC24A1O60721 1099 aa27.99■■■□□ 2.07
ACTB-210ENST00000477812 SLAIN2Q9P270 581 aa27.99■■■□□ 2.07
ACTB-210ENST00000477812 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.97■■■□□ 2.07
ACTB-210ENST00000477812 TOM1O60784 492 aa27.97■■■□□ 2.07
ACTB-210ENST00000477812 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.96■■■□□ 2.07
ACTB-210ENST00000477812 CABP2Q9NPB3 220 aa27.96■■■□□ 2.07
ACTB-210ENST00000477812 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
ACTB-210ENST00000477812 NUTM2FA1L443 756 aa27.95■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 TMF1P82094 1093 aa27.95■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 ITSN1Q15811 1721 aa27.92■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.91■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.91■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 BRINP3Q76B58 766 aa27.9■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 ORAI2Q96SN7 254 aa27.9■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.89■■■□□ 2.06
ACTB-210ENST00000477812 KIF1AQ12756 1690 aa27.87■■■□□ 2.05
ACTB-210ENST00000477812 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.86■■■□□ 2.05
ACTB-210ENST00000477812 CDCA8Q53HL2 280 aa27.85■■■□□ 2.05
ACTB-210ENST00000477812 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.85■■■□□ 2.05
ACTB-210ENST00000477812 PIP4K2BP78356 416 aa27.84■■■□□ 2.05
ACTB-210ENST00000477812 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.84■■■□□ 2.05
ACTB-210ENST00000477812 MYOM1P52179 1685 aa27.84■■■□□ 2.05
ACTB-210ENST00000477812 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.83■■■□□ 2.05
ACTB-210ENST00000477812 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.83■■■□□ 2.05
ACTB-210ENST00000477812 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.83■■■□□ 2.05
ACTB-210ENST00000477812 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
ACTB-210ENST00000477812 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
ACTB-210ENST00000477812 CABP1Q9NZU7 370 aa27.8■■■□□ 2.04
ACTB-210ENST00000477812 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.8■■■□□ 2.04
ACTB-210ENST00000477812 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.8■■■□□ 2.04
ACTB-210ENST00000477812 CCDC7Q96M83 1385 aa27.79■■■□□ 2.04
ACTB-210ENST00000477812 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.79■■■□□ 2.04
ACTB-210ENST00000477812 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.78■■■□□ 2.04
ACTB-210ENST00000477812 PXDNQ92626 1479 aa27.76■■■□□ 2.04
ACTB-210ENST00000477812 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.04
ACTB-210ENST00000477812 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 FBXO41Q8TF61 875 aa27.76■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.76■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 ACEP12821 1306 aa27.75■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 FOXO3O43524 673 aa27.75■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 AKAP12Q02952 1782 aa27.74■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.73■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 TMC1Q8TDI8 760 aa27.72■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PP64 1363 aa27.71■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.7■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.7■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 PHLPP1O60346 1717 aa27.7■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.69■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 USP6P35125 1406 aa27.69■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 SSH2Q76I76 1423 aa27.69■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.69■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.65■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.65■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 SBNO1A3KN83 1393 aa27.64■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 PSME1Q06323 249 aa27.64■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
ACTB-210ENST00000477812 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
ACTB-210ENST00000477812 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
ACTB-210ENST00000477812 HSPA1LP34931 641 aa27.63■■■□□ 2.01
ACTB-210ENST00000477812 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
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