RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 PIK3R4Q99570 1358 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-207ENST00000471650 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1-207ENST00000471650 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1-207ENST00000471650 NUP155O75694 1391 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1-207ENST00000471650 KANK1Q14678 1352 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1-207ENST00000471650 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP1-207ENST00000471650 C1orf167Q5SNV9 1468 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1-207ENST00000471650 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP1-207ENST00000471650 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.88■□□□□ 0.13
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SH3BP1-207ENST00000471650 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1-207ENST00000471650 SLIT2O94813 1529 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-207ENST00000471650 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1-207ENST00000471650 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-207ENST00000471650 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-207ENST00000471650 METP08581 1390 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1-207ENST00000471650 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 PXDNQ92626 1479 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
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SH3BP1-207ENST00000471650 E9PCH4 1651 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 USP32Q8NFA0 1604 aa15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1-207ENST00000471650 BAG6P46379 1132 aa15.77■□□□□ 0.12
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SH3BP1-207ENST00000471650 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.75■□□□□ 0.11
SH3BP1-207ENST00000471650 UTRNP46939 3433 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-207ENST00000471650 DISP2A7MBM2 1401 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-207ENST00000471650 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM182BQ5T319 152 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-207ENST00000471650 CEP350Q5VT06 3117 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1-207ENST00000471650 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1-207ENST00000471650 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.7■□□□□ 0.1
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SH3BP1-207ENST00000471650 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.7■□□□□ 0.1
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SH3BP1-207ENST00000471650 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1-207ENST00000471650 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.64■□□□□ 0.09
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SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1-207ENST00000471650 CLTCL1P53675 1640 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1-207ENST00000471650 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1-207ENST00000471650 ADGRB2O60241 1585 aa15.62■□□□□ 0.09
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SH3BP1-207ENST00000471650 A0A0G2JS52 829 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1-207ENST00000471650 MYT1Q01538 1121 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1-207ENST00000471650 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP1-207ENST00000471650 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP1-207ENST00000471650 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.59■□□□□ 0.09
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SH3BP1-207ENST00000471650 PLEKHG5O94827 1062 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 MYOM1P52179 1685 aa15.57■□□□□ 0.08
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SH3BP1-207ENST00000471650 CASZ1Q86V15 1759 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 NUTM2FA1L443 756 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 NEUROD1Q13562 356 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 CHD4Q14839 1912 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 TRIM37O94972 964 aa15.54■□□□□ 0.08
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SH3BP1-207ENST00000471650 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 KIF1AQ12756 1690 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 RGL3Q3MIN7 710 aa15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SH3BP1-207ENST00000471650 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SH3BP1-207ENST00000471650 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-207ENST00000471650 APBA3O96018 575 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP1-207ENST00000471650 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
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SH3BP1-207ENST00000471650 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
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