RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468220.1

CLDN16-203, Transcript of claudin 16, humanhuman

TSL 4

Gene CLDN16, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16-203ENST00000468220 MYT1Q01538 1121 aa10.21□□□□□ -0.77
CLDN16-203ENST00000468220 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
CLDN16-203ENST00000468220 HRCP23327 699 aa10.2□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.2□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 MYOM2P54296 1465 aa10.18□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.18□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.18□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 NUTM2FA1L443 756 aa10.17□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.17□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 YY1P25490 414 aa10.17□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 ITGAEP38570 1179 aa10.17□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 VPS72Q15906 364 aa10.17□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 E9PCH4 1651 aa10.16□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 PLEKHG5O94827 1062 aa10.16□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 HFM1A2PYH4 1435 aa10.16□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 ROCK1Q13464 1354 aa10.15□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.15□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 PSME1Q06323 249 aa10.15□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CLDN16-203ENST00000468220 LRP5O75197 1615 aa10.15□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.14□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.14□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.14□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.14□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 LAMC1P11047 1609 aa10.14□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 SLIT2O94813 1529 aa10.13□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10.13□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 PXDNQ92626 1479 aa10.12□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.12□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 STK26Q9P289 416 aa10.12□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 GLI3P10071 1580 aa10.11□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.11□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.1□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.1□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.09□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 NAIPQ13075 1403 aa10.09□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CLDN16-203ENST00000468220 FAM83GA6ND36 823 aa10.08□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 NBPF8Q3BBV2 869 aa10.08□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 NBPF14Q5TI25 921 aa10.08□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.08□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.07□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.07□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 FAM182BQ5T319 152 aa10.07□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 BTG4Q9NY30 223 aa10.07□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.06□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 ARHGEF10O15013 1369 aa10.06□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 APBA3O96018 575 aa10.06□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.06□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.05□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.05□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 TRIM37O94972 964 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 SPON1Q9HCB6 807 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 CLTCL1P53675 1640 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 USP32Q8NFA0 1604 aa10.04□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 SBNO1A3KN83 1393 aa10.03□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 RGL3Q3MIN7 710 aa10.03□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 ABCC11Q96J66 1382 aa10.02□□□□□ -0.8
CLDN16-203ENST00000468220 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.02□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.02□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.02□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.02□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 PARD3Q8TEW0 1356 aa10.01□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.01□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 DISP2A7MBM2 1401 aa10.01□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.01□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 KCNQ2O43526 872 aa10.01□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 PDE3BQ13370 1112 aa10.01□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 SIRT1Q96EB6 747 aa10.01□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 PRDM11Q9NQV5 511 aa10□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 TECPR2O15040 1411 aa9.99□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.99□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 EVA1CP58658 441 aa9.99□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 STRN4Q9NRL3 753 aa9.99□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 POGKQ9P215 609 aa9.99□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 KIF1AQ12756 1690 aa9.99□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.99□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 KIF1BO60333 1816 aa9.98□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 USP35Q9P2H5 1018 aa9.98□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.98□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.98□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.97□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CLDN16-203ENST00000468220 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms