RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SYNE4-204ENST00000465425 EVC2Q86UK5 1308 aa23.81■■□□□ 1.4
SYNE4-204ENST00000465425 WWC1Q8IX03 1113 aa23.81■■□□□ 1.4
SYNE4-204ENST00000465425 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.8■■□□□ 1.4
SYNE4-204ENST00000465425 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
SYNE4-204ENST00000465425 GLI2P10070 1586 aa23.79■■□□□ 1.4
SYNE4-204ENST00000465425 RUNDC1Q96C34 613 aa23.79■■□□□ 1.4
SYNE4-204ENST00000465425 CFAP53Q96M91 514 aa23.78■■□□□ 1.4
SYNE4-204ENST00000465425 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SYNE4-204ENST00000465425 NEUROD2Q15784 382 aa23.77■■□□□ 1.4
SYNE4-204ENST00000465425 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.76■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 MTHFSP49914 203 aa23.76■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 PIK3C2BO00750 1634 aa23.76■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 USP32Q8NFA0 1604 aa23.76■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.75■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.75■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.75■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 SHPRHQ149N8 1683 aa23.74■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.74■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 PDE3AQ14432 1141 aa23.73■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.73■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 BCL11AQ9H165 835 aa23.73■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.73■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.73■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 NSD2O96028 1365 aa23.73■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 IDI1Q13907 227 aa23.72■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 FAM161AQ3B820 660 aa23.72■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.71■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.71■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
SYNE4-204ENST00000465425 CABP2Q9NPB3 220 aa23.7■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 RGS3P49796 1198 aa23.7■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.68■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 WDR63Q8IWG1 891 aa23.68■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 STK26Q9P289 416 aa23.67■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 ZFYVE9O95405 1425 aa23.66■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 C8orf34Q49A92 452 aa23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC27Q2M243 656 aa23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 COG6Q9Y2V7 657 aa23.65■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 RICTORQ6R327 1708 aa23.64■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 PANK1Q8TE04 598 aa23.64■■□□□ 1.38
SYNE4-204ENST00000465425 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.64■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 IGHDP01880 384 aa23.61■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.61■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PP64 1363 aa23.61■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 ABCC11Q96J66 1382 aa23.6■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 NEFMP07197 916 aa23.59■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 POGKQ9P215 609 aa23.59■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.58■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 USP35Q9P2H5 1018 aa23.58■■□□□ 1.37
SYNE4-204ENST00000465425 AAMPQ13685 434 aa23.58■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.58■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 PRAM1Q96QH2 718 aa23.56■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.56■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.56■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.55■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.55■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.55■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 PTPRMP28827 1452 aa23.54■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.54■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.54■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.54■■□□□ 1.36
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 ADGRB2O60241 1585 aa23.51■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 FYB1O15117 783 aa23.5■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 RLBP1P12271 317 aa23.5■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 SLC4A3P48751 1232 aa23.49■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.47■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 TNNQ9UQP3 1299 aa23.47■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 MED14O60244 1454 aa23.46■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.45■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 CDK19Q9BWU1 502 aa23.45■■□□□ 1.35
SYNE4-204ENST00000465425 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.45■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.45■■□□□ 1.34
SYNE4-204ENST00000465425 ALKQ9UM73 1620 aa23.45■■□□□ 1.34
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