RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 WWC1Q8IX03 1113 aa26.65■■□□□ 1.86
IMP4-208ENST00000460766 NEO1Q92859 1461 aa26.64■■□□□ 1.86
IMP4-208ENST00000460766 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.64■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 NEUROD2Q15784 382 aa26.63■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 EVC2Q86UK5 1308 aa26.63■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.61■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 GLI2P10070 1586 aa26.61■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 MTHFSP49914 203 aa26.6■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 RUNDC1Q96C34 613 aa26.6■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 IDI1Q13907 227 aa26.59■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.58■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.58■■□□□ 1.85
IMP4-208ENST00000460766 CFAP53Q96M91 514 aa26.57■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 CABP2Q9NPB3 220 aa26.57■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 PIK3C2BO00750 1634 aa26.57■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.56■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 SHPRHQ149N8 1683 aa26.56■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.55■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.55■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 STK26Q9P289 416 aa26.54■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.53■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 RGS3P49796 1198 aa26.53■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 USP32Q8NFA0 1604 aa26.52■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.51■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.51■■□□□ 1.84
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 PDE3AQ14432 1141 aa26.51■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 BCL11AQ9H165 835 aa26.51■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 FAM161AQ3B820 660 aa26.49■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 NSD2O96028 1365 aa26.49■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 PANK1Q8TE04 598 aa26.48■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.48■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 COG6Q9Y2V7 657 aa26.47■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.47■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 C8orf34Q49A92 452 aa26.46■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 WDR63Q8IWG1 891 aa26.46■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
IMP4-208ENST00000460766 RICTORQ6R327 1708 aa26.45■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 IGHDP01880 384 aa26.45■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 ZFYVE9O95405 1425 aa26.45■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 A0A1W2PP64 1363 aa26.44■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.43■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 CCDC27Q2M243 656 aa26.42■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 PRAM1Q96QH2 718 aa26.41■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.41■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.4■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 POGKQ9P215 609 aa26.4■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 ABCC11Q96J66 1382 aa26.39■■□□□ 1.82
IMP4-208ENST00000460766 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.38■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.36■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 PTPRMP28827 1452 aa26.36■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.36■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 NEFMP07197 916 aa26.35■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.35■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.35■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.34■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.34■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 TNNQ9UQP3 1299 aa26.34■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.34■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 RLBP1P12271 317 aa26.33■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 SLC4A3P48751 1232 aa26.33■■□□□ 1.81
IMP4-208ENST00000460766 FYB1O15117 783 aa26.32■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.28■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.28■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 ADGRB2O60241 1585 aa26.28■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 AAMPQ13685 434 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 CDK19Q9BWU1 502 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 USP35Q9P2H5 1018 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-208ENST00000460766 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.26■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 CABP1Q9NZU7 370 aa26.25■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 ALKQ9UM73 1620 aa26.24■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
IMP4-208ENST00000460766 NLRP1Q9C000 1473 aa26.22■■□□□ 1.79
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