RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 TULP4Q9NRJ4 1543 aa17.7■□□□□ 0.42
NISCH-203ENST00000460759 STK26Q9P289 416 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-203ENST00000460759 PRAM1Q96QH2 718 aa17.68■□□□□ 0.42
NISCH-203ENST00000460759 PTCH1Q13635 1447 aa17.67■□□□□ 0.42
NISCH-203ENST00000460759 CERKQ8TCT0 537 aa17.67■□□□□ 0.42
NISCH-203ENST00000460759 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
NISCH-203ENST00000460759 ADGRB2O60241 1585 aa17.66■□□□□ 0.42
NISCH-203ENST00000460759 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.66■□□□□ 0.42
NISCH-203ENST00000460759 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
NISCH-203ENST00000460759 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 PANK3Q9H999 370 aa17.62■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.62■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa17.62■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 RALBP1Q15311 655 aa17.61■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 SLC26A8Q96RN1 970 aa17.6■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 PTPRUQ92729 1446 aa17.6■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 USP32Q8NFA0 1604 aa17.6■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 STRCQ7RTU9 1775 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 ROBO2Q9HCK4 1378 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-203ENST00000460759 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.58■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.58■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 PARD3Q8TEW0 1356 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 WAPLQ7Z5K2 1190 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 NWD1Q149M9 1564 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 ATP7BP35670 1465 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 WASLO00401 505 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 CDK19Q9BWU1 502 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 TMC1Q8TDI8 760 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 CABP2Q9NPB3 220 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 TERF2IPQ9NYB0 399 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-203ENST00000460759 NSD2O96028 1365 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 ITSN1Q15811 1721 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 NSD3Q9BZ95 1437 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa17.49■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 NLRP13Q86W25 1043 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 CGNL1Q0VF96 1302 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 KCNA6P17658 529 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 MRS2Q9HD23 443 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 A0A1W2PP64 1363 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 ANKARQ7Z5J8 1434 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 CD163L1Q9NR16 1453 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 CARD14Q9BXL6 1004 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 CCDC61Q9Y6R9 512 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-203ENST00000460759 FMN2Q9NZ56 1722 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 AKAP12Q02952 1782 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 MON2Q7Z3U7 1717 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 NALCNQ8IZF0 1738 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 KIF20BQ96Q89 1820 aa17.42■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa17.41■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 CABP1Q9NZU7 370 aa17.41■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 LTBP4Q8N2S1 1624 aa17.39■□□□□ 0.38
NISCH-203ENST00000460759 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 INSRP06213 1382 aa17.39■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 PLEKHG3A1L390 1219 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 PRR36Q9H6K5 1346 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 PPP2R1AP30153 589 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 NRKQ7Z2Y5 1582 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 MORC1Q86VD1 984 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 CCDC184Q52MB2 194 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 DCCP43146 1447 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
NISCH-203ENST00000460759 STRCP1A6NGW2 1772 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-203ENST00000460759 USP6P35125 1406 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-203ENST00000460759 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-203ENST00000460759 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-203ENST00000460759 IQSEC2Q5JU85 1478 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-203ENST00000460759 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-203ENST00000460759 UBAP1LF5GYI3 381 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-203ENST00000460759 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-203ENST00000460759 ACEP12821 1306 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-203ENST00000460759 FYB1O15117 783 aa17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms