RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 PTGDRQ13258 359 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 ZPR1O75312 459 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAJB2P25686 324 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 NUTM2FA1L443 756 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-203ENST00000459697 LCE2BO14633 110 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 ADAMTS12P58397 1594 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 HSPA1LP34931 641 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 RCCD1A6NED2 376 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM161AQ3B820 660 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 P3H3Q8IVL6 736 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 STRCQ7RTU9 1775 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 FCHSD2O94868 740 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 CUL7Q14999 1698 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCC2Q92887 1545 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF223E7ERA6 249 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGGTB-203ENST00000459697 CFHP08603 1231 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC19A1P41440 591 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPRTO14522 1441 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SEMA3EO15041 775 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 TLL1O43897 1013 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 OATP04181 439 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC10A3P09131 477 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PIP4K2BP78356 416 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 NR1I2O75469 434 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 S1PR4O95977 384 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 CUX1P39880 1505 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF787Q6DD87 383 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 SPRYD7Q5W111 196 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.15□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 ADH1BP00325 375 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 HIC1Q14526 733 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPRGP23470 1445 aa9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 CD109Q6YHK3 1445 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 PKDCCQ504Y2 493 aa9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.1□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 DGAT1O75907 488 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR20EP86478 221 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR20CP86479 221 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR20DP86480 221 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR20BP86481 221 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 PRR20AP86496 221 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 POTEAQ6S8J7 498 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-203ENST00000459697 GNPATO15228 680 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-203ENST00000459697 SPSB2Q99619 263 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-203ENST00000459697 RDH13Q8NBN7 331 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-203ENST00000459697 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-203ENST00000459697 TNFRSF10AO00220 468 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-203ENST00000459697 RAPGEF3O95398 923 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-203ENST00000459697 FECHP22830 423 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-203ENST00000459697 MYT1Q01538 1121 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms