RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457708.1

USP9YP25-201, Transcript of USP9Y pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP25, Length 443 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP25-201ENST00000457708 CCDC102AQ96A19 550 aa10.81□□□□□ -0.68
USP9YP25-201ENST00000457708 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.81□□□□□ -0.68
USP9YP25-201ENST00000457708 USP46P62068 366 aa10.79□□□□□ -0.68
USP9YP25-201ENST00000457708 AAASQ9NRG9 546 aa10.79□□□□□ -0.68
USP9YP25-201ENST00000457708 POTECB2RU33 542 aa10.78□□□□□ -0.68
USP9YP25-201ENST00000457708 ST8SIA5O15466 376 aa10.77□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 CRIPAKQ8N1N5 446 aa10.77□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 HOXA2O43364 376 aa10.76□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 DXOO77932 396 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 AVPP01185 164 aa10.76□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 HLA-CQ95604 372 aa10.76□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 BCANQ96GW7 911 aa10.76□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 GPCPD1Q9NPB8 672 aa10.75□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 CLCN1P35523 988 aa10.74□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 CYP4X1Q8N118 509 aa10.74□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 TRIM32Q13049 653 aa10.73□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 WNT7AO00755 349 aa10.72□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 TREML4Q6UXN2 200 aa10.71□□□□□ -0.69
USP9YP25-201ENST00000457708 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 GUCA2AQ02747 115 aa10.69□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 CTC1Q2NKJ3 1217 aa10.69□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 DACH1Q9UI36 760 aa10.68□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 SMPD1P17405 629 aa10.66□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 JUNDP17535 347 aa10.66□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.66□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 AXIN1O15169 862 aa10.65□□□□□ -0.7
USP9YP25-201ENST00000457708 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.64□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.64□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 BARGINQ6ZT62 677 aa10.63□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 RETREG3Q86VR2 466 aa10.63□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 WNT7BP56706 349 aa10.62□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 SKOR1P84550 965 aa10.62□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 PCDHGC3Q9UN70 934 aa10.62□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 ZMYND10O75800 440 aa10.61□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 FDX1P10109 184 aa10.61□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 J3QL48 77 aa10.6□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 AMHR2Q16671 573 aa10.6□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.59□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 STK17AQ9UEE5 414 aa10.59□□□□□ -0.71
USP9YP25-201ENST00000457708 WFS1O76024 890 aa10.58□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.58□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 C6orf229H3BNL8 230 aa10.55□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 HPS1Q92902 700 aa10.55□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.55□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.54□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 MS4A1P11836 297 aa10.54□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 NDUFV2P19404 249 aa10.54□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.53□□□□□ -0.72
USP9YP25-201ENST00000457708 SIAH2O43255 324 aa10.52□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 PTPRNQ16849 979 aa10.52□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 ALDH1A1P00352 501 aa10.49□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 GJA5P36382 358 aa10.49□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 DESI1Q6ICB0 168 aa10.49□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 PRR7Q8TB68 274 aa10.49□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 TRIM47Q96LD4 638 aa10.49□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.49□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.49□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.48□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 WIPF1O43516 503 aa10.48□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 SH3BP2P78314 561 aa10.48□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 MTMR2Q13614 643 aa10.48□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.48□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.48□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 SENP2Q9HC62 589 aa10.48□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.47□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.46□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 KCNH2Q12809 1159 aa10.46□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.46□□□□□ -0.73
USP9YP25-201ENST00000457708 TRIM66O15016 1216 aa10.45□□□□□ -0.74
USP9YP25-201ENST00000457708 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.45□□□□□ -0.74
USP9YP25-201ENST00000457708 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
USP9YP25-201ENST00000457708 KIFC2Q96AC6 838 aa10.43□□□□□ -0.74
USP9YP25-201ENST00000457708 SPTLC1O15269 473 aa10.42□□□□□ -0.74
USP9YP25-201ENST00000457708 BAP1Q92560 729 aa10.42□□□□□ -0.74
USP9YP25-201ENST00000457708 LINC01559Q495D7 138 aa10.41□□□□□ -0.74
USP9YP25-201ENST00000457708 ZNF511Q8NB15 262 aa10.41□□□□□ -0.74
USP9YP25-201ENST00000457708 AK7Q96M32 723 aa10.41□□□□□ -0.74
USP9YP25-201ENST00000457708 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.41□□□□□ -0.74
USP9YP25-201ENST00000457708 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms