RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 E9PSI1 815 aa20.97■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 IDI1Q13907 227 aa20.97■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 BACH2Q9BYV9 841 aa20.97■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
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SHQ1-202ENST00000444040 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.96■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.96■□□□□ 0.95
SHQ1-202ENST00000444040 ZFYVE9O95405 1425 aa20.95■□□□□ 0.94
SHQ1-202ENST00000444040 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.94■□□□□ 0.94
SHQ1-202ENST00000444040 EVC2Q86UK5 1308 aa20.93■□□□□ 0.94
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SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.91■□□□□ 0.94
SHQ1-202ENST00000444040 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SHQ1-202ENST00000444040 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SHQ1-202ENST00000444040 BCAR3O75815 825 aa20.89■□□□□ 0.94
SHQ1-202ENST00000444040 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.88■□□□□ 0.93
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SHQ1-202ENST00000444040 RUNDC1Q96C34 613 aa20.88■□□□□ 0.93
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SHQ1-202ENST00000444040 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.87■□□□□ 0.93
SHQ1-202ENST00000444040 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.87■□□□□ 0.93
SHQ1-202ENST00000444040 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SHQ1-202ENST00000444040 CABP2Q9NPB3 220 aa20.86■□□□□ 0.93
SHQ1-202ENST00000444040 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.84■□□□□ 0.93
SHQ1-202ENST00000444040 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.84■□□□□ 0.93
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SHQ1-202ENST00000444040 CFAP53Q96M91 514 aa20.82■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.82■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 STK26Q9P289 416 aa20.81■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PP64 1363 aa20.81■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 ABCC11Q96J66 1382 aa20.81■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 PDE3AQ14432 1141 aa20.8■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 NEUROD2Q15784 382 aa20.8■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC27Q2M243 656 aa20.8■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.8■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 WDR63Q8IWG1 891 aa20.79■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
SHQ1-202ENST00000444040 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
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SHQ1-202ENST00000444040 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.75■□□□□ 0.91
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SHQ1-202ENST00000444040 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
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SHQ1-202ENST00000444040 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.74■□□□□ 0.91
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SHQ1-202ENST00000444040 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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SHQ1-202ENST00000444040 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 DIP2BQ9P265 1576 aa20.73■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 NLRP1Q9C000 1473 aa20.72■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 REREQ9P2R6 1566 aa20.72■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 C8orf34Q49A92 452 aa20.72■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.72■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 MED14O60244 1454 aa20.72■□□□□ 0.91
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SHQ1-202ENST00000444040 POGKQ9P215 609 aa20.72■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 AGLP35573 1532 aa20.71■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 FYB1O15117 783 aa20.71■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 FAM161AQ3B820 660 aa20.71■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.71■□□□□ 0.91
SHQ1-202ENST00000444040 COG6Q9Y2V7 657 aa20.7■□□□□ 0.9
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.7■□□□□ 0.9
SHQ1-202ENST00000444040 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.7■□□□□ 0.9
SHQ1-202ENST00000444040 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.7■□□□□ 0.9
SHQ1-202ENST00000444040 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
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SHQ1-202ENST00000444040 RGS3P49796 1198 aa20.67■□□□□ 0.9
SHQ1-202ENST00000444040 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.67■□□□□ 0.9
SHQ1-202ENST00000444040 CDK19Q9BWU1 502 aa20.67■□□□□ 0.9
SHQ1-202ENST00000444040 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.66■□□□□ 0.9
SHQ1-202ENST00000444040 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.66■□□□□ 0.9
SHQ1-202ENST00000444040 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.66■□□□□ 0.9
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SHQ1-202ENST00000444040 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.65■□□□□ 0.9
SHQ1-202ENST00000444040 RLBP1P12271 317 aa20.64■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 DLC1Q96QB1 1528 aa20.64■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 AAMPQ13685 434 aa20.63■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 CABP1Q9NZU7 370 aa20.63■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 TNNQ9UQP3 1299 aa20.63■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.63■□□□□ 0.89
SHQ1-202ENST00000444040 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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