RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440778.5

CCDC18-AS1-212, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 USP46P62068 366 aa11.84□□□□□ -0.51
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NLRP7Q8WX94 980 aa11.84□□□□□ -0.51
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MYT1Q01538 1121 aa11.82□□□□□ -0.52
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SMARCA4P51532 1647 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FAM187AA6NFU0 413 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TNFRSF10AO00220 468 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KDM4AO75164 1064 aa11.8□□□□□ -0.52
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MMP16P51512 607 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.78□□□□□ -0.52
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CLCN1P35523 988 aa11.77□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.76□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FOXC1Q12948 553 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CCDC102AQ96A19 550 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.74□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CYP4X1Q8N118 509 aa11.73□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.73□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 AVPP01185 164 aa11.72□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.72□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HOXA2O43364 376 aa11.71□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 WNT7AO00755 349 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 AAASQ9NRG9 546 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRIM32Q13049 653 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.66□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.65□□□□□ -0.54
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 WIZO95785 1651 aa11.64□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 WNT7BP56706 349 aa11.63□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 AXIN1O15169 862 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 JUNDP17535 347 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RETREG3Q86VR2 466 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SMARCA2P51531 1590 aa11.62□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HMGXB3Q12766 1538 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ST8SIA5O15466 376 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NCAPD3P42695 1498 aa11.61□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 BARGINQ6ZT62 677 aa11.59□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 AMHR2Q16671 573 aa11.57□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HLA-CQ95604 372 aa11.57□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.57□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 POTECB2RU33 542 aa11.56□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZMYND10O75800 440 aa11.56□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FDX1P10109 184 aa11.56□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.56□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.55□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.54□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SMPD1P17405 629 aa11.54□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.54□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GJA5P36382 358 aa11.53□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GUCA2AQ02747 115 aa11.52□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C6orf229H3BNL8 230 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.51□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MS4A1P11836 297 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PTPRNQ16849 979 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 DESI1Q6ICB0 168 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SENP2Q9HC62 589 aa11.5□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TREML4Q6UXN2 200 aa11.49□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SKOR1P84550 965 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.48□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KIFC2Q96AC6 838 aa11.47□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 J3QL48 77 aa11.46□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MTMR2Q13614 643 aa11.46□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.46□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 DACH1Q9UI36 760 aa11.46□□□□□ -0.57
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.44□□□□□ -0.58
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.44□□□□□ -0.58
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.43□□□□□ -0.58
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRIM47Q96LD4 638 aa11.43□□□□□ -0.58
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.42□□□□□ -0.58
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SIAH2O43255 324 aa11.41□□□□□ -0.58
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ALDH1A1P00352 501 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms