RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438233.2

CYCSP43-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 43, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP43, Length 310 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP43-201ENST00000438233 GPR153Q6NV75 609 aa6.62□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.61□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 CD109Q6YHK3 1445 aa6.61□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.61□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 OATP04181 439 aa6.61□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 PBX2P40425 430 aa6.61□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.61□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.61□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 PADI6Q6TGC4 694 aa6.6□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 ILDR2Q71H61 639 aa6.6□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.6□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 GOPCQ9HD26 462 aa6.6□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 MS4A1P11836 297 aa6.59□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.59□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.59□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 SAMD9Q5K651 1589 aa6.59□□□□□ -1.35
CYCSP43-201ENST00000438233 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 TTC13Q8NBP0 860 aa6.58□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.58□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 PRSS12P56730 875 aa6.57□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.57□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 PHOX2BQ99453 314 aa6.57□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 LHX6Q9UPM6 363 aa6.57□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.57□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.57□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 NEO1Q92859 1461 aa6.56□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.56□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.56□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.55□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 ATP10BO94823 1461 aa6.55□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 FAM161AQ3B820 660 aa6.55□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 STAC3Q96MF2 364 aa6.55□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.55□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.54□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.54□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 PTPREP23469 700 aa6.54□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 MYT1Q01538 1121 aa6.54□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.54□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.54□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 C3P01024 1663 aa6.53□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.53□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.53□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 HECW1Q76N89 1606 aa6.53□□□□□ -1.36
CYCSP43-201ENST00000438233 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.52□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.52□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 SOCS7O14512 581 aa6.52□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 COL9A1P20849 921 aa6.52□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 GOLGA3Q08378 1498 aa6.52□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.51□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 NBPF26B4DH59 902 aa6.51□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 FLIIQ13045 1269 aa6.51□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 NLRP7Q8WX94 980 aa6.51□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 PRXQ9BXM0 1461 aa6.51□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.5□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 FANCAO15360 1455 aa6.5□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 HSPA2P54652 639 aa6.5□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.5□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 KCNH8Q96L42 1107 aa6.5□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.5□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 TSKSQ9UJT2 592 aa6.5□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 ABCA6Q8N139 1617 aa6.5□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 KDM5CP41229 1560 aa6.49□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.49□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 RCCD1A6NED2 376 aa6.49□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.49□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 RAPGEF3O95398 923 aa6.49□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 HOMEZQ8IX15 550 aa6.49□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 EYA1Q99502 592 aa6.49□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 ZMYND15Q9H091 742 aa6.49□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.48□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.48□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.48□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 DNAJB2P25686 324 aa6.48□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.48□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 PACS2Q86VP3 889 aa6.48□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 SULF1Q8IWU6 871 aa6.48□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 REREQ9P2R6 1566 aa6.48□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 TATDN2Q93075 761 aa6.47□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 PNMA3Q9UL41 463 aa6.47□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.47□□□□□ -1.37
CYCSP43-201ENST00000438233 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms