RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa19.73■□□□□ 0.75
SFRP4-201ENST00000436072 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SFRP4-201ENST00000436072 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.72■□□□□ 0.75
SFRP4-201ENST00000436072 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.71■□□□□ 0.75
SFRP4-201ENST00000436072 RLBP1P12271 317 aa19.71■□□□□ 0.75
SFRP4-201ENST00000436072 EFCAB6Q5THR3 1501 aa19.7■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 ANTXR1Q9H6X2 564 aa19.7■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.7■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 NOS1P29475 1434 aa19.7■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.7■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 NPATQ14207 1427 aa19.69■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP19.69■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 WWC1Q8IX03 1113 aa19.69■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 PDE3AQ14432 1141 aa19.68■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 CDCA8Q53HL2 280 aa19.68■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 IQGAP1P46940 1657 aa19.67■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 KIF1BO60333 1816 aa19.67■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 STAC3Q96MF2 364 aa19.66■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.66■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.66■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 MROH2AA6NES4 1674 aa19.66■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.65■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.65■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.65■□□□□ 0.74
SFRP4-201ENST00000436072 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.64■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.64■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.64■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 ABCA6Q8N139 1617 aa19.63■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.63■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.63■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 PIK3C2GO75747 1445 aa19.62■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 MCM4P33991 863 aa19.62■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 NLRP1Q9C000 1473 aa19.61■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.61■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.6■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.6■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.59■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SFRP4-201ENST00000436072 TRAK2O60296 914 aa19.58■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 IDI1Q13907 227 aa19.57■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 STK26Q9P289 416 aa19.57■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 MYOM2P54296 1465 aa19.57■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.56■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 ERVK-7P63135 1459 aa19.56■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 ABCC3O15438 1527 aa19.56■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 C22orf23Q9BZE7 217 aa19.56■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.56■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 MORC1Q86VD1 984 aa19.56■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 MLECQ14165 292 aa19.55■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 NEO1Q92859 1461 aa19.55■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 ADGRB3O60242 1522 aa19.54■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 SYNMO15061 1565 aa19.53■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.53■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 FSD2A1L4K1 749 aa19.52■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 MYOM1P52179 1685 aa19.52■□□□□ 0.72
SFRP4-201ENST00000436072 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 TSPOAP1O95153 1857 aa19.52■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.52■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.51■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 CHMP5Q9NZZ3 219 aa19.51■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 IFT172Q9UG01 1749 aa19.51■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 RUNDC1Q96C34 613 aa19.51■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.51■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa19.49■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 VGFO15240 615 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.48■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 MTHFSP49914 203 aa19.48■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.48■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 CABP2Q9NPB3 220 aa19.47■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.47■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 MVPQ14764 893 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.47■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 PPLO60437 1756 aa19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 HSCBQ8IWL3 235 aa19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 NEURL4Q96JN8 1562 aa19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 RICTORQ6R327 1708 aa19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 CLCN1P35523 988 aa19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 GRPEL1Q9HAV7 217 aa19.46■□□□□ 0.71
SFRP4-201ENST00000436072 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
SFRP4-201ENST00000436072 ERBB4Q15303 1308 aa19.45■□□□□ 0.7
SFRP4-201ENST00000436072 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.44■□□□□ 0.7
SFRP4-201ENST00000436072 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.44■□□□□ 0.7
SFRP4-201ENST00000436072 NSD3Q9BZ95 1437 aa19.44■□□□□ 0.7
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