RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.55□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.55□□□□□ -0.24
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMF1P82094 1093 aa13.54□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDCA8Q53HL2 280 aa13.54□□□□□ -0.24
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBX22Q9Y458 520 aa13.54□□□□□ -0.24
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.54□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DLC1Q96QB1 1528 aa13.54□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.54□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MED14O60244 1454 aa13.54□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PIK3R4Q99570 1358 aa13.54□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.54□□□□□ -0.24
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 QRICH2Q9H0J4 1663 aa13.52□□□□□ -0.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCC11Q96J66 1382 aa13.52□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STK26Q9P289 416 aa13.52□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POGKQ9P215 609 aa13.51□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LMTK3Q96Q04 1460 aa13.51□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 METP08581 1390 aa13.51□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TECPR2O15040 1411 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.5□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CPS1P31327 1500 aa13.5□□□□□ -0.25
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.49□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.48□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYOM1P52179 1685 aa13.47□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRAM1Q96QH2 718 aa13.47□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.47□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PANK3Q9H999 370 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EVC2Q86UK5 1308 aa13.46□□□□□ -0.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTCH1Q13635 1447 aa13.46□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HSPA2P54652 639 aa13.44□□□□□ -0.26
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.44□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PTPRUQ92729 1446 aa13.43□□□□□ -0.26
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MRS2Q9HD23 443 aa13.41□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ROBO2Q9HCK4 1378 aa13.4□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KCNA6P17658 529 aa13.4□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.4□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADGRB2O60241 1585 aa13.4□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.4□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STRCQ7RTU9 1775 aa13.4□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATAD2Q6PL18 1390 aa13.4□□□□□ -0.26
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PARD3Q8TEW0 1356 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RALBP1Q15311 655 aa13.39□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.38□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PITPNM1O00562 1244 aa13.38□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM9BQ8IZU0 186 aa13.36□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDK19Q9BWU1 502 aa13.35□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.34□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.34□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.34□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMC1Q8TDI8 760 aa13.34□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CABP2Q9NPB3 220 aa13.34□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.33□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C14orf37Q86TY3 774 aa13.33□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.33□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa13.33□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HAX1O00165 279 aa13.32□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa13.32□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ITSN1Q15811 1721 aa13.31□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.31□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NALCNQ8IZF0 1738 aa13.3□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.3□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.3□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NLRP13Q86W25 1043 aa13.3□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.3□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKARQ7Z5J8 1434 aa13.3□□□□□ -0.28
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
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