RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.81■■□□□ 1.88
SUMO3-204ENST00000411651 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.81■■□□□ 1.88
SUMO3-204ENST00000411651 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
SUMO3-204ENST00000411651 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SUMO3-204ENST00000411651 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.77■■□□□ 1.88
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF521Q96K83 1311 aa26.76■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 ABCC11Q96J66 1382 aa26.74■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 MORC1Q86VD1 984 aa26.74■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.73■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 MED14O60244 1454 aa26.73■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 MLECQ14165 292 aa26.73■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 TNRQ92752 1358 aa26.72■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 PRAM1Q96QH2 718 aa26.72■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 POGKQ9P215 609 aa26.71■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 STK26Q9P289 416 aa26.71■■□□□ 1.87
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.7■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 SHPRHQ149N8 1683 aa26.7■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.7■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 CABP2Q9NPB3 220 aa26.69■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.69■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 A0A1W2PP64 1363 aa26.68■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.68■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.67■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 SIRT1Q96EB6 747 aa26.67■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.67■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 TECPR2O15040 1411 aa26.67■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.67■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.67■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 NLRP1Q9C000 1473 aa26.66■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.65■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA2Q08379 1002 aa26.64■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SUMO3-204ENST00000411651 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.64■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 ATP7BP35670 1465 aa26.62■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 CFAP53Q96M91 514 aa26.62■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.62■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 CPS1P31327 1500 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 CDK19Q9BWU1 502 aa26.59■■□□□ 1.85
SUMO3-204ENST00000411651 SLFN5Q08AF3 891 aa26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.56■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 APAF1O14727 1248 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 MTHFSP49914 203 aa26.55■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 E9PSI1 815 aa26.54■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 METP08581 1390 aa26.54■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.53■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.53■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 RUNDC1Q96C34 613 aa26.53■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.52■■□□□ 1.84
SUMO3-204ENST00000411651 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 FYB1O15117 783 aa26.49■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 SLIT1O75093 1534 aa26.49■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.49■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC27Q2M243 656 aa26.49■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 C3P01024 1663 aa26.48■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 ADGRB2O60241 1585 aa26.48■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.47■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.47■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 CABP1Q9NZU7 370 aa26.46■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.46■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
SUMO3-204ENST00000411651 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.45■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.45■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.44■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 WWC1Q8IX03 1113 aa26.43■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 WDR63Q8IWG1 891 aa26.42■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.41■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 DIP2AQ14689 1571 aa26.4■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.4■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.39■■□□□ 1.82
SUMO3-204ENST00000411651 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.39■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.37■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 AKAP12Q02952 1782 aa26.36■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 EID1Q9Y6B2 187 aa26.36■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.36■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.34■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 LTKP29376 864 aa26.33■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms