RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391293.1

5S_rRNA.2-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 112 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 USP32Q8NFA0 1604 aa3.59□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.58□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TRIM37O94972 964 aa3.58□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 APBA3O96018 575 aa3.58□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SYCP2Q9BX26 1530 aa3.58□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TOMM70O94826 608 aa3.57□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 VPS72Q15906 364 aa3.57□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa3.57□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PREX2Q70Z35 1606 aa3.57□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PRDM10Q9NQV6 1147 aa3.57□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa3.56□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 A0A0G2JS52 829 aa3.56□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CCDC85CA6NKD9 419 aa3.56□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FOXN1O15353 648 aa3.56□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MYT1Q01538 1121 aa3.56□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ARXQ96QS3 562 aa3.56□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CHIC1Q5VXU3 224 aa3.55□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MTFR1LQ9H019 292 aa3.55□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa3.55□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 GRIN3BO60391 1043 aa3.54□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NLGN2Q8NFZ4 835 aa3.54□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PIK3C2BO00750 1634 aa3.54□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TRPM2O94759 1503 aa3.54□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TULP4Q9NRJ4 1543 aa3.54□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NOS1P29475 1434 aa3.53□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PLCH1Q4KWH8 1693 aa3.53□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KIF3BO15066 747 aa3.53□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SZT2Q5T011 3432 aa3.53□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 C1orf167Q5SNV9 1468 aa3.53□□□□□ -1.84
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PRAG1Q86YV5 1406 aa3.53□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa3.53□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 COL6A3P12111 3177 aa3.52□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FAM196AQ6ZSG2 479 aa3.52□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NMRK2Q9NPI5 230 aa3.52□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa3.52□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NWD2Q9ULI1 1742 aa3.52□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PXDNQ92626 1479 aa3.52□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PTPN23Q9H3S7 1636 aa3.52□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CHGAP10645 457 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FSTL1Q12841 308 aa3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KLHL34Q8N239 644 aa3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ADGRL2O95490 1459 aa3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa3.51□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MEGF6O75095 1541 aa3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 LBX1P52954 281 aa3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SLC17A8Q8NDX2 589 aa3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZFYVE9O95405 1425 aa3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CLIP1P30622 1438 aa3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PTPRUQ92729 1446 aa3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NRAPQ86VF7 1730 aa3.5□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 BCANQ96GW7 911 aa3.49□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CFAP44Q96MT7 982 aa3.49□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ORAI2Q96SN7 254 aa3.49□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TBX22Q9Y458 520 aa3.49□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa3.49□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PIK3R4Q99570 1358 aa3.49□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa3.49□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PRXQ9BXM0 1461 aa3.48□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 VCANP13611 3396 aa3.48□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NALCNQ8IZF0 1738 aa3.48□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 GCC1Q96CN9 775 aa3.48□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ABCA3Q99758 1704 aa3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PKD1L2Q7Z442 2459 aa3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SLC15A2Q16348 729 aa3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PROM2Q8N271 834 aa3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SNX27Q96L92 541 aa3.47□□□□□ -1.85
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 STAG3Q9UJ98 1225 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms