RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFT172Q9UG01 1749 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUP155O75694 1391 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP32Q8NFA0 1604 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTCH1Q13635 1447 aa8.46□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 NRAPQ86VF7 1730 aa8.46□□□□□ -1.05
RNU6-171P-201ENST00000384354 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 ROCK1Q13464 1354 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLIT2O94813 1529 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUTM2FA1L443 756 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITGAEP38570 1179 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF1AQ12756 1690 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 APLP2Q06481 763 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 NAIPQ13075 1403 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.4□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOXO3O43524 673 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLEKHG5O94827 1062 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 HFM1A2PYH4 1435 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 ALS2Q96Q42 1657 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 RREB1Q92766 1687 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM182BQ5T319 152 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 TECPR2O15040 1411 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOXD1Q16676 465 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 HRCP23327 699 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-171P-201ENST00000384354 STK26Q9P289 416 aa8.34□□□□□ -1.07
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RNU6-171P-201ENST00000384354 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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RNU6-171P-201ENST00000384354 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIK3C2GO75747 1445 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 VPS72Q15906 364 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 SBF2Q86WG5 1849 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADGRB2O60241 1585 aa8.31□□□□□ -1.08
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RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM83GA6ND36 823 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCC11Q96J66 1382 aa8.28□□□□□ -1.08
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0G2JS52 829 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYT1Q01538 1121 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGL3Q3MIN7 710 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 DISP2A7MBM2 1401 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADGRB1O14514 1584 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 UTRNP46939 3433 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 SBNO1A3KN83 1393 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 BTG4Q9NY30 223 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYOM1P52179 1685 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-171P-201ENST00000384354 PEAK1Q9H792 1746 aa8.26□□□□□ -1.09
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