RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364072.1

RNU6-501P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 501, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-501P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-501P-201ENST00000364072 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 BRICD5Q6PL45 260 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 IFFO2Q5TF58 517 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 ADH1BP00325 375 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RNU6-501P-201ENST00000364072 LILRB3O75022 631 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 HRCP23327 699 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 QPCTQ16769 361 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 SPSB2Q99619 263 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 C6orf229H3BNL8 230 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 MTMR2Q13614 643 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 MSS51Q4VC12 460 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 RETREG3Q86VR2 466 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRR7Q8TB68 274 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 CFAP99D6REC4 459 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 S1PR4O95977 384 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-501P-201ENST00000364072 MMP16P51512 607 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 A0A0G2JS52 829 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 JUNDP17535 347 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 RFC5P40937 340 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 DESI1Q6ICB0 168 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 RNF223E7ERA6 249 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 GGCXP38435 758 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RNU6-501P-201ENST00000364072 LYPD8Q6UX82 237 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 TSC1Q92574 1164 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 AP1G2O75843 785 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 PTPRNQ16849 979 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP17L8P0C7I0 530 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 BANK1Q8NDB2 785 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 KCNH2Q12809 1159 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 MAP10Q9P2G4 905 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 SNRKQ9NRH2 765 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 SOCS7O14512 581 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 CTHP32929 405 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 RPIAP49247 311 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 RGS20O76081 388 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC19A1P41440 591 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 MCM6Q14566 821 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 NR6A1Q15406 480 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-501P-201ENST00000364072 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-501P-201ENST00000364072 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-501P-201ENST00000364072 TRIM32Q13049 653 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-501P-201ENST00000364072 SPRYD7Q5W111 196 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-501P-201ENST00000364072 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-501P-201ENST00000364072 FLIIQ13045 1269 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-501P-201ENST00000364072 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-501P-201ENST00000364072 APBB1O00213 710 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-501P-201ENST00000364072 GPR37L1O60883 481 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-501P-201ENST00000364072 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms