RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362091.8

FBXO18-201, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO18, Length 3,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FBXO18-201ENST00000362091 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.45■■□□□ 1.02
FBXO18-201ENST00000362091 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.45■■□□□ 1.02
FBXO18-201ENST00000362091 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.45■■□□□ 1.02
FBXO18-201ENST00000362091 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FBXO18-201ENST00000362091 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.45■■□□□ 1.02
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FBXO18-201ENST00000362091 ZMYM3Q14202 1370 aa21.42■■□□□ 1.02
FBXO18-201ENST00000362091 WDR63Q8IWG1 891 aa21.4■■□□□ 1.02
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FBXO18-201ENST00000362091 ESPNB1AK53 854 aa21.4■■□□□ 1.02
FBXO18-201ENST00000362091 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.4■■□□□ 1.02
FBXO18-201ENST00000362091 CLTCL1P53675 1640 aa21.4■■□□□ 1.02
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FBXO18-201ENST00000362091 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.38■■□□□ 1.01
FBXO18-201ENST00000362091 TRPM2O94759 1503 aa21.38■■□□□ 1.01
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FBXO18-201ENST00000362091 STAC3Q96MF2 364 aa21.34■■□□□ 1.01
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FBXO18-201ENST00000362091 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
FBXO18-201ENST00000362091 TRIM27P14373 513 aa21.33■■□□□ 1.01
FBXO18-201ENST00000362091 AFAP1Q8N556 730 aa21.33■■□□□ 1.01
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FBXO18-201ENST00000362091 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.3■■□□□ 1
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FBXO18-201ENST00000362091 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.25■□□□□ 0.99
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FBXO18-201ENST00000362091 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.25■□□□□ 0.99
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FBXO18-201ENST00000362091 KANK1Q14678 1352 aa21.24■□□□□ 0.99
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FBXO18-201ENST00000362091 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.24■□□□□ 0.99
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FBXO18-201ENST00000362091 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
FBXO18-201ENST00000362091 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.16■□□□□ 0.98
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FBXO18-201ENST00000362091 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.15■□□□□ 0.98
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