RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 NF2P35240 595 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXW7Q969H0 707 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 MCM5P33992 734 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 BRMS1Q9HCU9 246 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF214Q8ND24 703 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP9Q49MG5 647 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMA5P28066 241 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 DACH1Q9UI36 760 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 HIP1O00291 1037 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 COG6Q9Y2V7 657 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP2-201ENST00000356331 ERICH4A6NGS2 130 aa12.71□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 XBP1P17861 261 aa12.71□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 JMYQ8N9B5 988 aa12.71□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 BICD2Q8TD16 824 aa12.71□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBB4BP68371 445 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 LUZP1Q86V48 1076 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 USP47Q96K76 1375 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 ERC2O15083 957 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 MICALCLQ6ZW33 695 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 DYNC1I1O14576 645 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC112Q8NEF3 446 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 WIZO95785 1651 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CBFA2T2O43439 604 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CTR9Q6PD62 1173 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA24Q86W54 205 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CBX1P83916 185 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 MCM4P33991 863 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS53Q5VIR6 699 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 POTEB2H3BUK9 544 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 FILIP1LQ4L180 1135 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 STK26Q9P289 416 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF3BO15066 747 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 ODF2Q5BJF6 829 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 PKD2Q13563 968 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 PRDM2Q13029 1718 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 MARCH6O60337 910 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CAVIN2O95810 425 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 GIMAP7Q8NHV1 300 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM5Q9C035 493 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 KINO60870 393 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC192P0DO97 292 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CPLX1O14810 134 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 TRDNQ13061 729 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF21BO75037 1637 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 EPS15P42566 896 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CLCN1P35523 988 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 ANO2Q9NQ90 1003 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD1Q15327 319 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 TOMM22Q9NS69 142 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-201ENST00000356331 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.65□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 TXLNAP40222 546 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 NEMFO60524 1076 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 PLCD4Q9BRC7 762 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 TIGD1Q96MW7 591 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBB4AP04350 444 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 SHTN1A0MZ66 631 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 FOSBP53539 338 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 ERICH2A1L162 156 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP2-201ENST00000356331 SPC24Q8NBT2 197 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms