RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 WWC1Q8IX03 1113 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.64■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 MORC1Q86VD1 984 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 ABCC3O15438 1527 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 GLI2P10070 1586 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 PIK3C2BO00750 1634 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 RUNDC1Q96C34 613 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 RGS3P49796 1198 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SPNS3-201ENST00000355530 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 NSD2O96028 1365 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 CD109Q6YHK3 1445 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 AAMPQ13685 434 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 CFAP53Q96M91 514 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 GGT6Q6P531 493 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 WDR63Q8IWG1 891 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 IGHDP01880 384 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC27Q2M243 656 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS3-201ENST00000355530 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 ADGRB2O60241 1585 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 EVC2Q86UK5 1308 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 PANK1Q8TE04 598 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 COG6Q9Y2V7 657 aa23.5■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 MTHFSP49914 203 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 NEUROD2Q15784 382 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 SLC4A3P48751 1232 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 NEO1Q92859 1461 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 ZMYM3Q14202 1370 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 NFKBIBQ15653 356 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS3-201ENST00000355530 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS3-201ENST00000355530 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS3-201ENST00000355530 ZFYVE9O95405 1425 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS3-201ENST00000355530 ABCC11Q96J66 1382 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS3-201ENST00000355530 USP19O94966 1318 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 RICTORQ6R327 1708 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 NLRP1Q9C000 1473 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 RLBP1P12271 317 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 GSE1Q14687 1217 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PP64 1363 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 MED14O60244 1454 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 CABP2Q9NPB3 220 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 PTPRMP28827 1452 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS3-201ENST00000355530 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 TNNQ9UQP3 1299 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 RAPGEF3O95398 923 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 BECN1Q14457 450 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 IDI1Q13907 227 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 SEC24BO95487 1268 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 OSCARQ8IYS5 282 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS3-201ENST00000355530 IL16Q14005 1332 aa23.26■■□□□ 1.31
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