RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 MYOM2P54296 1465 aa9.82□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 KCNA6P17658 529 aa9.81□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 METP08581 1390 aa9.81□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.81□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 TMEM94Q12767 1356 aa9.81□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 CPS1P31327 1500 aa9.81□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 HOMEZQ8IX15 550 aa9.8□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.79□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 DLC1Q96QB1 1528 aa9.79□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 HSPA1LP34931 641 aa9.78□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.78□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.78□□□□□ -0.84
CCR6-202ENST00000349984 PIK3R4Q99570 1358 aa9.77□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.77□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.77□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.76□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.76□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.75□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.74□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 STK26Q9P289 416 aa9.74□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.74□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.74□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.74□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 C14orf37Q86TY3 774 aa9.73□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.73□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 TBX22Q9Y458 520 aa9.73□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.73□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.72□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 MST1RQ04912 1400 aa9.72□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 TOM1O60784 492 aa9.72□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.71□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 NUTM2FA1L443 756 aa9.71□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.71□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.71□□□□□ -0.85
CCR6-202ENST00000349984 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.71□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 ABCC6O95255 1503 aa9.7□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.69□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 PIK3C2GO75747 1445 aa9.69□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 TECPR2O15040 1411 aa9.68□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 DCCP43146 1447 aa9.68□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 MSH6P52701 1360 aa9.68□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 ILDR2Q71H61 639 aa9.68□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 SLAIN2Q9P270 581 aa9.68□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 PRDM4Q9UKN5 801 aa9.68□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 USP35Q9P2H5 1018 aa9.67□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.67□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 KIF1AQ12756 1690 aa9.67□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 PHLPP1O60346 1717 aa9.66□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.65□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.65□□□□□ -0.86
CCR6-202ENST00000349984 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 ORAI2Q96SN7 254 aa9.65□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 NEFMP07197 916 aa9.64□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 BRINP3Q76B58 766 aa9.64□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.64□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 ATF3P18847 181 aa9.63□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.63□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.63□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 EP400Q96L91 3159 aa9.63□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 ADGRB1O14514 1584 aa9.63□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 ITSN1Q15811 1721 aa9.63□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.63□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 PTCH1Q13635 1447 aa9.62□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.62□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 PRAM1Q96QH2 718 aa9.62□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CCR6-202ENST00000349984 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.61□□□□□ -0.87
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