RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.92■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.91■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.91■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.9■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 EID1Q9Y6B2 187 aa21.9■■□□□ 1.1
HPS1-202ENST00000338546 PPP2R1AP30153 589 aa21.88■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.88■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 METP08581 1390 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 NSD2O96028 1365 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 CPS1P31327 1500 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 MED14O60244 1454 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 CABP2Q9NPB3 220 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 LTKP29376 864 aa21.83■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
HPS1-202ENST00000338546 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.83■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 CDK19Q9BWU1 502 aa21.82■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 DIP2AQ14689 1571 aa21.82■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 BCANQ96GW7 911 aa21.81■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.81■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 TBX22Q9Y458 520 aa21.8■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.78■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS1-202ENST00000338546 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 ATP7BP35670 1465 aa21.76■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 A0A1W2PP64 1363 aa21.75■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 MORC1Q86VD1 984 aa21.75■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.73■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 PIK3R4Q99570 1358 aa21.73■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 ADGRB2O60241 1585 aa21.73■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 NEFLP07196 543 aa21.72■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 PDE3BQ13370 1112 aa21.72■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.71■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 PTCH1Q13635 1447 aa21.71■■□□□ 1.07
HPS1-202ENST00000338546 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.7■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 CABP1Q9NZU7 370 aa21.69■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.68■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 NUDCQ9Y266 331 aa21.68■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.68■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 PTPRUQ92729 1446 aa21.67■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.65■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.65■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.65■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 NGEFQ8N5V2 710 aa21.65■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.65■■□□□ 1.06
HPS1-202ENST00000338546 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.64■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 CFAP53Q96M91 514 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 FYB1O15117 783 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 FKBP8Q14318 412 aa21.6■■□□□ 1.05
HPS1-202ENST00000338546 MTHFSP49914 203 aa21.57■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.57■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 AKAP12Q02952 1782 aa21.57■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.57■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.57■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 SHPRHQ149N8 1683 aa21.55■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.55■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 ITSN1Q15811 1721 aa21.55■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.54■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.53■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HPS1-202ENST00000338546 ZNF521Q96K83 1311 aa21.52■■□□□ 1.03
HPS1-202ENST00000338546 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS1-202ENST00000338546 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS1-202ENST00000338546 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HPS1-202ENST00000338546 KCNA6P17658 529 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS1-202ENST00000338546 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS1-202ENST00000338546 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HPS1-202ENST00000338546 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
HPS1-202ENST00000338546 RUNDC1Q96C34 613 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS1-202ENST00000338546 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HPS1-202ENST00000338546 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.45■■□□□ 1.02
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