RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326153.9

GTPBP6-201, Transcript of GTP binding protein 6 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTPBP6, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6-201ENST00000326153 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.72■■■□□ 2.19
GTPBP6-201ENST00000326153 INSRP06213 1382 aa28.71■■■□□ 2.19
GTPBP6-201ENST00000326153 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.71■■■□□ 2.19
GTPBP6-201ENST00000326153 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.71■■■□□ 2.19
GTPBP6-201ENST00000326153 PPP2R1AP30153 589 aa28.7■■■□□ 2.18
GTPBP6-201ENST00000326153 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
GTPBP6-201ENST00000326153 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.68■■■□□ 2.18
GTPBP6-201ENST00000326153 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
GTPBP6-201ENST00000326153 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.68■■■□□ 2.18
GTPBP6-201ENST00000326153 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.67■■■□□ 2.18
GTPBP6-201ENST00000326153 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.65■■■□□ 2.18
GTPBP6-201ENST00000326153 MED14O60244 1454 aa28.64■■■□□ 2.18
GTPBP6-201ENST00000326153 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.64■■■□□ 2.18
GTPBP6-201ENST00000326153 EID1Q9Y6B2 187 aa28.64■■■□□ 2.18
GTPBP6-201ENST00000326153 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
GTPBP6-201ENST00000326153 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.62■■■□□ 2.17
GTPBP6-201ENST00000326153 METP08581 1390 aa28.6■■■□□ 2.17
GTPBP6-201ENST00000326153 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.59■■■□□ 2.17
GTPBP6-201ENST00000326153 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
GTPBP6-201ENST00000326153 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.57■■■□□ 2.16
GTPBP6-201ENST00000326153 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.57■■■□□ 2.16
GTPBP6-201ENST00000326153 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
GTPBP6-201ENST00000326153 PDE3BQ13370 1112 aa28.55■■■□□ 2.16
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.54■■■□□ 2.16
GTPBP6-201ENST00000326153 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.54■■■□□ 2.16
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.53■■■□□ 2.16
GTPBP6-201ENST00000326153 HSPA2P54652 639 aa28.52■■■□□ 2.16
GTPBP6-201ENST00000326153 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 DIP2AQ14689 1571 aa28.5■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.5■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 TBX22Q9Y458 520 aa28.49■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.49■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 STK26Q9P289 416 aa28.49■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 PTPRUQ92729 1446 aa28.48■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 EVC2Q86UK5 1308 aa28.48■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.47■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 ABCC11Q96J66 1382 aa28.47■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 TECPR2O15040 1411 aa28.45■■■□□ 2.15
GTPBP6-201ENST00000326153 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.45■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 DLC1Q96QB1 1528 aa28.45■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 STRCQ7RTU9 1775 aa28.43■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 USP32Q8NFA0 1604 aa28.43■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.42■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 CPS1P31327 1500 aa28.4■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.4■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 CABP2Q9NPB3 220 aa28.39■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.39■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
GTPBP6-201ENST00000326153 PRAM1Q96QH2 718 aa28.38■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.37■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.37■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 PIK3R4Q99570 1358 aa28.36■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.35■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 MORC1Q86VD1 984 aa28.35■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 ZNF521Q96K83 1311 aa28.34■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.34■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.34■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 SIRT1Q96EB6 747 aa28.33■■■□□ 2.13
GTPBP6-201ENST00000326153 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.32■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 PTCH1Q13635 1447 aa28.3■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.3■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.3■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 POGKQ9P215 609 aa28.3■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 KCNA6P17658 529 aa28.29■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 A0A1W2PP64 1363 aa28.27■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 SHPRHQ149N8 1683 aa28.27■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 NSD2O96028 1365 aa28.26■■■□□ 2.12
GTPBP6-201ENST00000326153 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.26■■■□□ 2.11
GTPBP6-201ENST00000326153 NWD1Q149M9 1564 aa28.26■■■□□ 2.11
GTPBP6-201ENST00000326153 APAF1O14727 1248 aa28.24■■■□□ 2.11
GTPBP6-201ENST00000326153 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.24■■■□□ 2.11
GTPBP6-201ENST00000326153 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
GTPBP6-201ENST00000326153 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.23■■■□□ 2.11
GTPBP6-201ENST00000326153 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.22■■■□□ 2.11
GTPBP6-201ENST00000326153 GOLGA2Q08379 1002 aa28.22■■■□□ 2.11
GTPBP6-201ENST00000326153 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.2■■■□□ 2.11
GTPBP6-201ENST00000326153 MTHFSP49914 203 aa28.2■■■□□ 2.1
GTPBP6-201ENST00000326153 CDK19Q9BWU1 502 aa28.2■■■□□ 2.1
GTPBP6-201ENST00000326153 ADGRB2O60241 1585 aa28.18■■■□□ 2.1
GTPBP6-201ENST00000326153 SLFN5Q08AF3 891 aa28.18■■■□□ 2.1
GTPBP6-201ENST00000326153 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.18■■■□□ 2.1
GTPBP6-201ENST00000326153 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
GTPBP6-201ENST00000326153 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.16■■■□□ 2.1
GTPBP6-201ENST00000326153 NGEFQ8N5V2 710 aa28.14■■■□□ 2.1
GTPBP6-201ENST00000326153 PLIN1O60240 522 aa28.14■■■□□ 2.09
GTPBP6-201ENST00000326153 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
GTPBP6-201ENST00000326153 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
GTPBP6-201ENST00000326153 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
GTPBP6-201ENST00000326153 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.11■■■□□ 2.09
GTPBP6-201ENST00000326153 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.8 ms