RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa32.33■■■□□ 2.77
SENP3-201ENST00000321337 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
SENP3-201ENST00000321337 FAM43AQ8N2R8 423 aa32.32■■■□□ 2.77
SENP3-201ENST00000321337 ARXQ96QS3 562 aa32.32■■■□□ 2.77
SENP3-201ENST00000321337 TRAK1Q9UPV9 953 aa32.31■■■□□ 2.76
SENP3-201ENST00000321337 DEPDC5O75140 1603 aa32.31■■■□□ 2.76
SENP3-201ENST00000321337 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
SENP3-201ENST00000321337 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.3■■■□□ 2.76
SENP3-201ENST00000321337 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.29■■■□□ 2.76
SENP3-201ENST00000321337 MTHFSP49914 203 aa32.29■■■□□ 2.76
SENP3-201ENST00000321337 KANK1Q14678 1352 aa32.27■■■□□ 2.76
SENP3-201ENST00000321337 MYOM2P54296 1465 aa32.26■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.24■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 CHGAP10645 457 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 WDR63Q8IWG1 891 aa32.23■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 TMEM132EQ6IEE7 984 aa32.22■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 MROH2AA6NES4 1674 aa32.21■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 SLC24A1O60721 1099 aa32.21■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 NOS1P29475 1434 aa32.21■■■□□ 2.75
SENP3-201ENST00000321337 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 MVPQ14764 893 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 ATP7AQ04656 1500 aa32.18■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa32.17■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.16■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.16■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 MYO3AQ8NEV4 1616 aa32.15■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP32.14■■■□□ 2.74
SENP3-201ENST00000321337 AAMPQ13685 434 aa32.13■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 IFT172Q9UG01 1749 aa32.13■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 KIF1BO60333 1816 aa32.13■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 NRXN1Q9ULB1 1477 aa32.13■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP32.12■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 CCDC27Q2M243 656 aa32.12■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.12■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 MCM4P33991 863 aa32.11■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa32.11■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 PANK2Q9BZ23 570 aa32.11■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 C22orf23Q9BZE7 217 aa32.11■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 MYH16Q9H6N6 1097 aa32.1■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 ZMYM3Q14202 1370 aa32.09■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 CFAP53Q96M91 514 aa32.08■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 RSPH6AQ9H0K4 717 aa32.08■■■□□ 2.73
SENP3-201ENST00000321337 FANCAO15360 1455 aa32.07■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 TRIM27P14373 513 aa32.07■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 SMC4Q9NTJ3 1288 aa32.06■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.06■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 QRICH2Q9H0J4 1663 aa32.05■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.04■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 SSH1Q8WYL5 1049 aa32.04■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 FSD2A1L4K1 749 aa32.03■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 ITPRIPQ8IWB1 547 aa32.03■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa32.02■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
SENP3-201ENST00000321337 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 ADGRB1O14514 1584 aa32■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 ADGRL1O94910 1474 aa31.99■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 CABP2Q9NPB3 220 aa31.99■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 ADGRB3O60242 1522 aa31.99■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 CD109Q6YHK3 1445 aa31.99■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP31.98■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 CHMP5Q9NZZ3 219 aa31.98■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.98■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 TRAK2O60296 914 aa31.98■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 TRIM35Q9UPQ4 493 aa31.98■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 TMEM57Q8N5G2 664 aa31.96■■■□□ 2.71
SENP3-201ENST00000321337 PLEKHF1Q96S99 279 aa31.95■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.94■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 TMPOP42166 694 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 ADGRB2O60241 1585 aa31.93■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa31.93■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa31.93■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 GGNBP2Q9H3C7 697 aa31.92■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 USP32Q8NFA0 1604 aa31.91■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 SMC5Q8IY18 1101 aa31.91■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 DDX19BQ9UMR2 479 aa31.91■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 TULP4Q9NRJ4 1543 aa31.9■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa31.9■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 GGT6Q6P531 493 aa31.89■■■□□ 2.7
SENP3-201ENST00000321337 NPATQ14207 1427 aa31.89■■■□□ 2.69
SENP3-201ENST00000321337 HSCBQ8IWL3 235 aa31.88■■■□□ 2.69
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