RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.69■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.68■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.67■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.67■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC11Q96J66 1382 aa24.67■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 PRAM1Q96QH2 718 aa24.66■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.66■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 SLIT1O75093 1534 aa24.64■■□□□ 1.54
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.64■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.64■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.63■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 METP08581 1390 aa24.63■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 POGKQ9P215 609 aa24.62■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 TECPR2O15040 1411 aa24.61■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.61■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.61■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.61■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 CPS1P31327 1500 aa24.6■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 NSD2O96028 1365 aa24.6■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.6■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.6■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 CABP2Q9NPB3 220 aa24.59■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.59■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HCLS1-201ENST00000314583 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.57■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 MED14O60244 1454 aa24.57■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.57■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.56■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 SIRT1Q96EB6 747 aa24.56■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 LTKP29376 864 aa24.56■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.55■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 MORC1Q86VD1 984 aa24.54■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.52■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.52■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.52■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
HCLS1-201ENST00000314583 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.51■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 CDK19Q9BWU1 502 aa24.51■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 SHPRHQ149N8 1683 aa24.5■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 A0A1W2PP64 1363 aa24.49■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 DIP2AQ14689 1571 aa24.48■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 EID1Q9Y6B2 187 aa24.48■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.47■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 NGEFQ8N5V2 710 aa24.47■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.47■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.47■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.46■■□□□ 1.51
HCLS1-201ENST00000314583 ADGRB2O60241 1585 aa24.45■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.44■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 PTPRUQ92729 1446 aa24.44■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF521Q96K83 1311 aa24.43■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 ATP7BP35670 1465 aa24.43■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.43■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.43■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 CFAP53Q96M91 514 aa24.41■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 TBX22Q9Y458 520 aa24.41■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
HCLS1-201ENST00000314583 GOLGA2Q08379 1002 aa24.37■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 CABP1Q9NZU7 370 aa24.37■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.37■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 PTCH1Q13635 1447 aa24.36■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.35■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 MTHFSP49914 203 aa24.35■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.34■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.34■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 APAF1O14727 1248 aa24.34■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.33■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.33■■□□□ 1.49
HCLS1-201ENST00000314583 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.32■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.32■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 AKAP12Q02952 1782 aa24.32■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.31■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 FYB1O15117 783 aa24.3■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 SLFN5Q08AF3 891 aa24.3■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 PIK3R4Q99570 1358 aa24.3■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 RUNDC1Q96C34 613 aa24.3■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.3■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 ITSN1Q15811 1721 aa24.29■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.28■■□□□ 1.48
HCLS1-201ENST00000314583 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
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