RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313285.12

TRIP10-202, Transcript of thyroid hormone receptor interactor 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIP10, Length 2,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10-202ENST00000313285 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa40.86■■■■■ 4.13
TRIP10-202ENST00000313285 ABCC11Q96J66 1382 aa40.85■■■■■ 4.13
TRIP10-202ENST00000313285 USP32Q8NFA0 1604 aa40.85■■■■■ 4.13
TRIP10-202ENST00000313285 NUDCQ9Y266 331 aa40.83■■■■■ 4.13
TRIP10-202ENST00000313285 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
TRIP10-202ENST00000313285 ATAD2Q6PL18 1390 aa40.81■■■■■ 4.12
TRIP10-202ENST00000313285 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
TRIP10-202ENST00000313285 C3P01024 1663 aa40.78■■■■■ 4.12
TRIP10-202ENST00000313285 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
TRIP10-202ENST00000313285 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.76■■■■■ 4.12
TRIP10-202ENST00000313285 CGNL1Q0VF96 1302 aa40.76■■■■■ 4.12
TRIP10-202ENST00000313285 ADAMTS8Q9UP79 889 aa40.76■■■■■ 4.11
TRIP10-202ENST00000313285 METP08581 1390 aa40.75■■■■■ 4.11
TRIP10-202ENST00000313285 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa40.74■■■■■ 4.11
TRIP10-202ENST00000313285 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP40.73■■■■■ 4.11
TRIP10-202ENST00000313285 NSD2O96028 1365 aa40.71■■■■■ 4.11
TRIP10-202ENST00000313285 PDE3BQ13370 1112 aa40.69■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 MORC1Q86VD1 984 aa40.69■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 SIRT1Q96EB6 747 aa40.69■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 CDK19Q9BWU1 502 aa40.69■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.68■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 TECPR2O15040 1411 aa40.68■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 BCANQ96GW7 911 aa40.67■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 A0A1W2PP64 1363 aa40.67■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.66■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.65■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 ERICH6BQ5W0A0 696 aa40.65■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.65■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.64■■■■■ 4.1
TRIP10-202ENST00000313285 TERF2IPQ9NYB0 399 aa40.62■■■■■ 4.09
TRIP10-202ENST00000313285 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.62■■■■■ 4.09
TRIP10-202ENST00000313285 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.61■■■■■ 4.09
TRIP10-202ENST00000313285 LTKP29376 864 aa40.61■■■■■ 4.09
TRIP10-202ENST00000313285 SLIT1O75093 1534 aa40.6■■■■■ 4.09
TRIP10-202ENST00000313285 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
TRIP10-202ENST00000313285 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.59■■■■■ 4.09
TRIP10-202ENST00000313285 CPS1P31327 1500 aa40.58■■■■■ 4.09
TRIP10-202ENST00000313285 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.56■■■■■ 4.08
TRIP10-202ENST00000313285 RNF123Q5XPI4 1314 aa40.56■■■■■ 4.08
TRIP10-202ENST00000313285 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
TRIP10-202ENST00000313285 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.55■■■■■ 4.08
TRIP10-202ENST00000313285 EID1Q9Y6B2 187 aa40.55■■■■■ 4.08
TRIP10-202ENST00000313285 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
TRIP10-202ENST00000313285 MED14O60244 1454 aa40.53■■■■■ 4.08
TRIP10-202ENST00000313285 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
TRIP10-202ENST00000313285 CABP1Q9NZU7 370 aa40.51■■■■■ 4.08
TRIP10-202ENST00000313285 WASLO00401 505 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
TRIP10-202ENST00000313285 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
TRIP10-202ENST00000313285 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
TRIP10-202ENST00000313285 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.47■■■■■ 4.07
TRIP10-202ENST00000313285 ATP7BP35670 1465 aa40.47■■■■■ 4.07
TRIP10-202ENST00000313285 MTHFSP49914 203 aa40.43■■■■■ 4.06
TRIP10-202ENST00000313285 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.43■■■■■ 4.06
TRIP10-202ENST00000313285 FYB1O15117 783 aa40.42■■■■■ 4.06
TRIP10-202ENST00000313285 CDCA7LQ96GN5 454 aa40.42■■■■■ 4.06
TRIP10-202ENST00000313285 ZNF521Q96K83 1311 aa40.4■■■■■ 4.06
TRIP10-202ENST00000313285 SHPRHQ149N8 1683 aa40.4■■■■■ 4.06
TRIP10-202ENST00000313285 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa40.39■■■■■ 4.06
TRIP10-202ENST00000313285 TBX22Q9Y458 520 aa40.38■■■■■ 4.06
TRIP10-202ENST00000313285 CFAP53Q96M91 514 aa40.38■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 GGNBP2Q9H3C7 697 aa40.38■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 CCDC146Q8IYE0 955 aa40.35■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 NGEFQ8N5V2 710 aa40.35■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.35■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 PPP4R2Q9NY27 417 aa40.34■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa40.34■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 PTPRUQ92729 1446 aa40.33■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 ADGRB2O60241 1585 aa40.32■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 RCAN3Q9UKA8 241 aa40.32■■■■■ 4.05
TRIP10-202ENST00000313285 DIP2AQ14689 1571 aa40.32■■■■■ 4.04
TRIP10-202ENST00000313285 CCDC61Q9Y6R9 512 aa40.31■■■■■ 4.04
TRIP10-202ENST00000313285 APAF1O14727 1248 aa40.3■■■■■ 4.04
TRIP10-202ENST00000313285 KIF20BQ96Q89 1820 aa40.28■■■■■ 4.04
TRIP10-202ENST00000313285 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.28■■■■■ 4.04
TRIP10-202ENST00000313285 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
TRIP10-202ENST00000313285 GOLGA2Q08379 1002 aa40.26■■■■■ 4.04
TRIP10-202ENST00000313285 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
TRIP10-202ENST00000313285 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.24■■■■■ 4.03
TRIP10-202ENST00000313285 PTCH1Q13635 1447 aa40.24■■■■■ 4.03
TRIP10-202ENST00000313285 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.24■■■■■ 4.03
TRIP10-202ENST00000313285 RRP1P56182 461 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
TRIP10-202ENST00000313285 RUNDC1Q96C34 613 aa40.2■■■■■ 4.03
TRIP10-202ENST00000313285 PRR36Q9H6K5 1346 aa40.2■■■■■ 4.03
TRIP10-202ENST00000313285 DUSP27Q5VZP5 1158 aa40.2■■■■■ 4.03
TRIP10-202ENST00000313285 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.18■■■■■ 4.02
TRIP10-202ENST00000313285 SLFN5Q08AF3 891 aa40.16■■■■■ 4.02
TRIP10-202ENST00000313285 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
TRIP10-202ENST00000313285 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
TRIP10-202ENST00000313285 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.16■■■■■ 4.02
TRIP10-202ENST00000313285 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
TRIP10-202ENST00000313285 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
TRIP10-202ENST00000313285 MON2Q7Z3U7 1717 aa40.15■■■■■ 4.02
TRIP10-202ENST00000313285 PNPLA6Q8IY17 1366 aa40.14■■■■■ 4.02
TRIP10-202ENST00000313285 PIK3R4Q99570 1358 aa40.14■■■■■ 4.02
TRIP10-202ENST00000313285 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.12■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms