RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
VSTM4-201ENST00000298454 METP08581 1390 aa30.6■■■□□ 2.49
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP8Q14318 412 aa30.59■■■□□ 2.49
VSTM4-201ENST00000298454 DLC1Q96QB1 1528 aa30.58■■■□□ 2.49
VSTM4-201ENST00000298454 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.58■■■□□ 2.49
VSTM4-201ENST00000298454 BCANQ96GW7 911 aa30.57■■■□□ 2.48
VSTM4-201ENST00000298454 ABCC11Q96J66 1382 aa30.57■■■□□ 2.48
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.56■■■□□ 2.48
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.55■■■□□ 2.48
VSTM4-201ENST00000298454 LTKP29376 864 aa30.54■■■□□ 2.48
VSTM4-201ENST00000298454 NEFLP07196 543 aa30.53■■■□□ 2.48
VSTM4-201ENST00000298454 CDK19Q9BWU1 502 aa30.52■■■□□ 2.48
VSTM4-201ENST00000298454 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.51■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.49■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.49■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 INSRP06213 1382 aa30.48■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.48■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.48■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 USP32Q8NFA0 1604 aa30.48■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.47■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PP64 1363 aa30.47■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.47■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 MORC1Q86VD1 984 aa30.46■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
VSTM4-201ENST00000298454 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 EID1Q9Y6B2 187 aa30.43■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 TECPR2O15040 1411 aa30.43■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 NUDCQ9Y266 331 aa30.42■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 SLIT1O75093 1534 aa30.42■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.42■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.41■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.41■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.39■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 SIRT1Q96EB6 747 aa30.39■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 CABP1Q9NZU7 370 aa30.39■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.39■■■□□ 2.46
VSTM4-201ENST00000298454 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.38■■■□□ 2.45
VSTM4-201ENST00000298454 CPS1P31327 1500 aa30.38■■■□□ 2.45
VSTM4-201ENST00000298454 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
VSTM4-201ENST00000298454 NSD2O96028 1365 aa30.36■■■□□ 2.45
VSTM4-201ENST00000298454 MED14O60244 1454 aa30.36■■■□□ 2.45
VSTM4-201ENST00000298454 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
VSTM4-201ENST00000298454 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
VSTM4-201ENST00000298454 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.35■■■□□ 2.45
VSTM4-201ENST00000298454 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
VSTM4-201ENST00000298454 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRUQ92729 1446 aa30.3■■■□□ 2.44
VSTM4-201ENST00000298454 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.3■■■□□ 2.44
VSTM4-201ENST00000298454 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.28■■■□□ 2.44
VSTM4-201ENST00000298454 FYB1O15117 783 aa30.27■■■□□ 2.44
VSTM4-201ENST00000298454 MTHFSP49914 203 aa30.27■■■□□ 2.44
VSTM4-201ENST00000298454 PDE3BQ13370 1112 aa30.27■■■□□ 2.44
VSTM4-201ENST00000298454 TBX22Q9Y458 520 aa30.27■■■□□ 2.44
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.25■■■□□ 2.43
VSTM4-201ENST00000298454 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.25■■■□□ 2.43
VSTM4-201ENST00000298454 ATP7BP35670 1465 aa30.25■■■□□ 2.43
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
VSTM4-201ENST00000298454 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.24■■■□□ 2.43
VSTM4-201ENST00000298454 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.23■■■□□ 2.43
VSTM4-201ENST00000298454 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.22■■■□□ 2.43
VSTM4-201ENST00000298454 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
VSTM4-201ENST00000298454 SHPRHQ149N8 1683 aa30.2■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC61Q9Y6R9 512 aa30.19■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.18■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 DIP2AQ14689 1571 aa30.17■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP53Q96M91 514 aa30.17■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.17■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRB2O60241 1585 aa30.16■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 RNF123Q5XPI4 1314 aa30.16■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 APAF1O14727 1248 aa30.15■■■□□ 2.42
VSTM4-201ENST00000298454 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.13■■■□□ 2.41
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF521Q96K83 1311 aa30.13■■■□□ 2.41
VSTM4-201ENST00000298454 PTCH1Q13635 1447 aa30.12■■■□□ 2.41
VSTM4-201ENST00000298454 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.12■■■□□ 2.41
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
VSTM4-201ENST00000298454 NUTM2FA1L443 756 aa30.11■■■□□ 2.41
VSTM4-201ENST00000298454 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.11■■■□□ 2.41
VSTM4-201ENST00000298454 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
VSTM4-201ENST00000298454 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.09■■■□□ 2.41
VSTM4-201ENST00000298454 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.08■■■□□ 2.41
VSTM4-201ENST00000298454 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 KCNA6P17658 529 aa30.05■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 NME9Q86XW9 330 aa30.05■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA2Q08379 1002 aa30.04■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.04■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 FBLN1P23142 703 aa30.03■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3R4Q99570 1358 aa30.03■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 RUNDC1Q96C34 613 aa30.03■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 ZRANB1Q9UGI0 708 aa30.03■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 AKAP12Q02952 1782 aa30.02■■■□□ 2.4
VSTM4-201ENST00000298454 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
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