RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 REREQ9P2R6 1566 aa36.54■■■■□ 3.44
UBP1-201ENST00000283628 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
UBP1-201ENST00000283628 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.51■■■■□ 3.44
UBP1-201ENST00000283628 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.49■■■■□ 3.43
UBP1-201ENST00000283628 DDRGK1Q96HY6 314 aa36.49■■■■□ 3.43
UBP1-201ENST00000283628 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.47■■■■□ 3.43
UBP1-201ENST00000283628 USP32Q8NFA0 1604 aa36.46■■■■□ 3.43
UBP1-201ENST00000283628 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
UBP1-201ENST00000283628 ADGRB1O14514 1584 aa36.45■■■■□ 3.43
UBP1-201ENST00000283628 AGLP35573 1532 aa36.45■■■■□ 3.43
UBP1-201ENST00000283628 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
UBP1-201ENST00000283628 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
UBP1-201ENST00000283628 SHPRHQ149N8 1683 aa36.42■■■■□ 3.42
UBP1-201ENST00000283628 SKAP1Q86WV1 359 aa36.41■■■■□ 3.42
UBP1-201ENST00000283628 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.41■■■■□ 3.42
UBP1-201ENST00000283628 NSD3Q9BZ95 1437 aa36.41■■■■□ 3.42
UBP1-201ENST00000283628 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.4■■■■□ 3.42
UBP1-201ENST00000283628 USP35Q9P2H5 1018 aa36.37■■■■□ 3.41
UBP1-201ENST00000283628 FAM161AQ3B820 660 aa36.36■■■■□ 3.41
UBP1-201ENST00000283628 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.35■■■■□ 3.41
UBP1-201ENST00000283628 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
UBP1-201ENST00000283628 MORC1Q86VD1 984 aa36.34■■■■□ 3.41
UBP1-201ENST00000283628 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.34■■■■□ 3.41
UBP1-201ENST00000283628 PDE3AQ14432 1141 aa36.33■■■■□ 3.41
UBP1-201ENST00000283628 WWC1Q8IX03 1113 aa36.32■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.32■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 BCAR3O75815 825 aa36.31■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.31■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 CGNL1Q0VF96 1302 aa36.3■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.3■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 IDI1Q13907 227 aa36.29■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.29■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.28■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 C8orf34Q49A92 452 aa36.27■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 RUNDC1Q96C34 613 aa36.27■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.27■■■■□ 3.4
UBP1-201ENST00000283628 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.25■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 ZFYVE9O95405 1425 aa36.23■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 NSD2O96028 1365 aa36.23■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.21■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 NEFMP07197 916 aa36.2■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
UBP1-201ENST00000283628 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.19■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 EVC2Q86UK5 1308 aa36.19■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 CFAP53Q96M91 514 aa36.19■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 WDR63Q8IWG1 891 aa36.18■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.17■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.17■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 AAMPQ13685 434 aa36.17■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 CCDC27Q2M243 656 aa36.16■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 CANXP27824 592 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.14■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 CLUAP1Q96AJ1 413 aa36.14■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 RGS3P49796 1198 aa36.14■■■■□ 3.38
UBP1-201ENST00000283628 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
UBP1-201ENST00000283628 MTHFSP49914 203 aa36.12■■■■□ 3.37
UBP1-201ENST00000283628 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.11■■■■□ 3.37
UBP1-201ENST00000283628 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
UBP1-201ENST00000283628 IGHDP01880 384 aa36.09■■■■□ 3.37
UBP1-201ENST00000283628 RARSP54136 660 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
UBP1-201ENST00000283628 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa36.09■■■■□ 3.37
UBP1-201ENST00000283628 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
UBP1-201ENST00000283628 ADGRB2O60241 1585 aa36.05■■■■□ 3.36
UBP1-201ENST00000283628 NEUROD2Q15784 382 aa36.05■■■■□ 3.36
UBP1-201ENST00000283628 PANK1Q8TE04 598 aa36.05■■■■□ 3.36
UBP1-201ENST00000283628 COG6Q9Y2V7 657 aa36.05■■■■□ 3.36
UBP1-201ENST00000283628 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
UBP1-201ENST00000283628 MYH16Q9H6N6 1097 aa36.01■■■■□ 3.35
UBP1-201ENST00000283628 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36■■■■□ 3.35
UBP1-201ENST00000283628 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
UBP1-201ENST00000283628 MLECQ14165 292 aa35.99■■■■□ 3.35
UBP1-201ENST00000283628 ZMYM3Q14202 1370 aa35.98■■■■□ 3.35
UBP1-201ENST00000283628 ABCC11Q96J66 1382 aa35.98■■■■□ 3.35
UBP1-201ENST00000283628 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.94■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 CABP2Q9NPB3 220 aa35.93■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.93■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP35.93■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 SLC4A3P48751 1232 aa35.92■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 A0A1W2PP64 1363 aa35.91■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 MED14O60244 1454 aa35.9■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 NFKBIBQ15653 356 aa35.9■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.89■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.89■■■■□ 3.34
UBP1-201ENST00000283628 ALKQ9UM73 1620 aa35.88■■■■□ 3.33
UBP1-201ENST00000283628 PTPRMP28827 1452 aa35.87■■■■□ 3.33
UBP1-201ENST00000283628 RLBP1P12271 317 aa35.86■■■■□ 3.33
UBP1-201ENST00000283628 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
UBP1-201ENST00000283628 USP19O94966 1318 aa35.84■■■■□ 3.33
UBP1-201ENST00000283628 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
UBP1-201ENST00000283628 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.83■■■■□ 3.33
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