RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
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UBE2B-201ENST00000265339 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.71■■■□□ 2.03
UBE2B-201ENST00000265339 SLC24A1O60721 1099 aa27.71■■■□□ 2.03
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UBE2B-201ENST00000265339 PIK3R4Q99570 1358 aa27.66■■■□□ 2.02
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UBE2B-201ENST00000265339 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.45■■□□□ 1.98
UBE2B-201ENST00000265339 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.42■■□□□ 1.98
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UBE2B-201ENST00000265339 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.36■■□□□ 1.97
UBE2B-201ENST00000265339 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.35■■□□□ 1.97
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UBE2B-201ENST00000265339 C14orf37Q86TY3 774 aa27.25■■□□□ 1.95
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UBE2B-201ENST00000265339 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
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UBE2B-201ENST00000265339 CCDC184Q52MB2 194 aa27.18■■□□□ 1.94
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.18■■□□□ 1.94
UBE2B-201ENST00000265339 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
UBE2B-201ENST00000265339 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.16■■□□□ 1.94
UBE2B-201ENST00000265339 ACEP12821 1306 aa27.16■■□□□ 1.94
UBE2B-201ENST00000265339 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
UBE2B-201ENST00000265339 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.14■■□□□ 1.94
UBE2B-201ENST00000265339 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.14■■□□□ 1.94
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